RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PCSK2	P16519	638 aa		5.34	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	POU4F3	Q15319	338 aa		5.34	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	AOC3	Q16853	763 aa		5.34	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		5.34	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	ATCAY	Q86WG3	371 aa		5.34	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	RAD18	Q9NS91	495 aa		5.34	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957		U3KQE9	123 aa		5.34	□□□□□ -1.55
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		5.33	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	EREG	O14944	169 aa		5.33	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	CEACAM5	P06731	702 aa		5.33	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM87A	P0C7U9	286 aa		5.33	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	RFX1	P22670	979 aa		5.33	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		5.33	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	PDGFA	P04085	211 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	C1QTNF9	P0C862	333 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDH1	Q08174	1060 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	EDEM1	Q92611	657 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	LGR6	Q9HBX8	967 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		5.32	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	AOC2	O75106	756 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	INHBB	P09529	407 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	OXCT1	P55809	520 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	CTSW	P56202	376 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK5R2	Q13319	367 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957		A6NHS1	94 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	NFIB	O00712	420 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	PHACTR2	O75167	634 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	GLI1	P08151	1106 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf34	Q49A92	452 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC16	Q8NEE8	873 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	CORO1B	Q9BR76	489 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR18	Q9BV38	432 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	METTL12	A8MUP2	240 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF21	O75509	655 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	AFM	P43652	599 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	CDCA8	Q53HL2	280 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A096LPE4	126 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PPZ6	126 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	ECEL1	O95672	775 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	FYB2	Q5VWT5	728 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	STK32A	Q8WU08	396 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AKAP13-223	ENST00000560957	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	TMPRSS2	O15393	492 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	CCNJL	Q8IV13	435 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	ASB11	Q8WXH4	323 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	CD320	Q9NPF0	282 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	LEFTY1	O75610	366 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	B3GALT4	O96024	378 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	ZP2	Q05996	745 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNA10	Q16322	511 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	PIDD1	Q9HB75	910 aa		5.26	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	MED14OS	P0DP75	135 aa		5.25	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXA5	P20719	270 aa		5.25	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	IKZF1	Q13422	519 aa		5.25	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE3A	Q14432	1141 aa		5.25	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	KIRREL1	Q96J84	757 aa		5.25	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	C20orf173	Q96LM9	149 aa		5.25	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	CSRNP1	Q96S65	589 aa		5.25	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	SEPT3	Q9UH03	358 aa		5.25	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		5.25	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	GRIA4	P48058	902 aa		5.24	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	EHHADH	Q08426	723 aa		5.24	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	AP3B2	Q13367	1082 aa		5.24	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		5.24	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		5.24	□□□□□ -1.57
AKAP13-223	ENST00000560957	RELT	Q969Z4	430 aa		5.24	□□□□□ -1.57

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