RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 AFMP43652 599 aa6.2□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.2□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.2□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.19□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM253P0C7T8 217 aa6.19□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 CES1P23141 567 aa6.19□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 OXCT1P55809 520 aa6.19□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 CDK5R2Q13319 367 aa6.19□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.19□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 MED14OSP0DP75 135 aa6.18□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.18□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 DIRC2Q96SL1 478 aa6.18□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 OSMRQ99650 979 aa6.18□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.18□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.18□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.18□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 MAOBP27338 520 aa6.17□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 NFKB2Q00653 900 aa6.17□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 KIRREL1Q96J84 757 aa6.17□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 KCNK12Q9HB15 430 aa6.17□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.16□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 ZBTB39O15060 712 aa6.16□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 NUAK1O60285 661 aa6.16□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 SYN1P17600 705 aa6.16□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 ZP2Q05996 745 aa6.16□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.16□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.16□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 CDCA8Q53HL2 280 aa6.15□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.15□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.15□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 CHRDQ9H2X0 955 aa6.15□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 RAD18Q9NS91 495 aa6.15□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 LEFTY1O75610 366 aa6.14□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00310P59036 64 aa6.14□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 POU4F3Q15319 338 aa6.14□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.14□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 RFX1P22670 979 aa6.13□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 GLDCP23378 1020 aa6.13□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 IKZF1Q13422 519 aa6.13□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 XKR5Q6UX68 686 aa6.13□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.13□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.13□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.13□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 ECEL1O95672 775 aa6.12□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 CYP11A1P05108 521 aa6.12□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 ITIH2P19823 946 aa6.12□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 NFIXQ14938 502 aa6.12□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.12□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 ASB11Q8WXH4 323 aa6.12□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.12□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.12□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 BMP7P18075 431 aa6.11□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.11□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.11□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.11□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 AOC2O75106 756 aa6.1□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 PMEPA1Q969W9 287 aa6.1□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 KCNC2Q96PR1 638 aa6.1□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 WDR18Q9BV38 432 aa6.1□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.1□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.1□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 STIM2Q9P246 746 aa6.1□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 METTL12A8MUP2 240 aa6.09□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 OCLNQ16625 522 aa6.09□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.09□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 CXorf38Q8TB03 319 aa6.09□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.09□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
FAM227B-211ENST00000560557 ADAMTS20P59510 1910 aa6.09□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 ABTB2Q8N961 1025 aa6.08□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.08□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.07□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 EREGO14944 169 aa6.07□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 TMPRSS2O15393 492 aa6.07□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 PRMT3O60678 531 aa6.07□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 PCDH1Q08174 1060 aa6.07□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 BORCS6Q96GS4 357 aa6.07□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.06□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 A6NHS1 94 aa6.06□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 ADRB1P08588 477 aa6.06□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 EDN3P14138 238 aa6.06□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 ATCAYQ86WG3 371 aa6.06□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.06□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 CORO1BQ9BR76 489 aa6.06□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.06□□□□□ -1.44
FAM227B-211ENST00000560557 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms