RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.67□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 LACRTQ9GZZ8 138 aa4.67□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 ADAM19Q9H013 955 aa4.67□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM39AQ9NV64 488 aa4.67□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 H2AFB2P0C5Z0 115 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 CDC27P30260 824 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF423Q2M1K9 1284 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 VPS37DQ86XT2 251 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 SULF2Q8IWU5 870 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 TRIM42Q8IWZ5 723 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM130Q8N3G9 435 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 STK35Q8TDR2 534 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 WFDC12Q8WWY7 111 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 SPATA32Q96LK8 384 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 SEMA6BQ9H3T3 888 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 UBP1Q9NZI7 540 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-205ENST00000558714 FAM177BA6PVY3 158 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 GREM1O60565 184 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 BMP6P22004 513 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 NME2P22392 152 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 CRKP46108 304 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 NASPP49321 788 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 PPP2R3AQ06190 1150 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 FAM117BQ6P1L5 589 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 GOLM1Q8NBJ4 401 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 WNT8BQ93098 351 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 GAL3ST3Q96A11 431 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 NT5C1AQ9BXI3 368 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 H3BRJ5 948 aa4.64□□□□□ -1.67
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TMOD3-205ENST00000558714 DYRK3O43781 588 aa4.64□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 F13A1P00488 732 aa4.64□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 NOS3P29474 1203 aa4.64□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 IREB2P48200 963 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 SOX9P48436 509 aa4.64□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 APOBRQ0VD83 1088 aa4.64□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 SEPT6Q14141 434 aa4.64□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 FAM196AQ6ZSG2 479 aa4.64□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 DPH6Q7L8W6 267 aa4.64□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 KLHL23Q8NBE8 558 aa4.64□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 SEC16BQ96JE7 1060 aa4.64□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 LRRC3Q9BY71 257 aa4.64□□□□□ -1.67
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TMOD3-205ENST00000558714 LMNB1P20700 586 aa4.63□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 ITGB7P26010 798 aa4.63□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 CD68P34810 354 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 CABP4P57796 275 aa4.63□□□□□ -1.67
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TMOD3-205ENST00000558714 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa4.63□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 IKBKEQ14164 716 aa4.63□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.63□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
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TMOD3-205ENST00000558714 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
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TMOD3-205ENST00000558714 EFR3BQ9Y2G0 817 aa4.63□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 FAM221AA4D161 298 aa4.62□□□□□ -1.67
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TMOD3-205ENST00000558714 FSCN2O14926 492 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 STK10O94804 968 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 ARNTP27540 789 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 RBL2Q08999 1139 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
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TMOD3-205ENST00000558714 TXNDC11Q6PKC3 985 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 Q6ZS46 218 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 SLITRK4Q8IW52 837 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 GATAD2BQ8WXI9 593 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 NRSN2Q9GZP1 204 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-205ENST00000558714 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
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