RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 ECEL1O95672 775 aa8.72□□□□□ -1.01
USP15-218ENST00000552346 B3GALT4O96024 378 aa8.72□□□□□ -1.01
USP15-218ENST00000552346 ASPAP45381 313 aa8.72□□□□□ -1.01
USP15-218ENST00000552346 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.72□□□□□ -1.01
USP15-218ENST00000552346 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
USP15-218ENST00000552346 ERCC3P19447 782 aa8.71□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 COL19A1Q14993 1142 aa8.71□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.71□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.71□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 ASIC4Q96FT7 647 aa8.71□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.71□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 ICMTO60725 284 aa8.7□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 NEFLP07196 543 aa8.7□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 OGFOD2Q6N063 350 aa8.7□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 EHD4Q9H223 541 aa8.7□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 ZNF576Q9H609 170 aa8.7□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.7□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 FZD5Q13467 585 aa8.69□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 PDE3AQ14432 1141 aa8.69□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.69□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.68□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 AOC2O75106 756 aa8.68□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 ITGB5P18084 799 aa8.68□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 ITPKAP23677 461 aa8.68□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.68□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 LGR6Q9HBX8 967 aa8.68□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.68□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 H3BRB1 525 aa8.67□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.67□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 WDR18Q9BV38 432 aa8.67□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 NPHS2Q9NP85 383 aa8.67□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 AP3B2Q13367 1082 aa8.66□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 ORC1Q13415 861 aa8.66□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.66□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.66□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.66□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 NDUFB5O43674 189 aa8.65□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 PDE3BQ13370 1112 aa8.65□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
USP15-218ENST00000552346 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.64□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 SERPINB4P48594 390 aa8.64□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 ECM1Q16610 540 aa8.64□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 TMPRSS2O15393 492 aa8.63□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 LIG1P18858 919 aa8.63□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.63□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.63□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.63□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 FAM129BQ96TA1 746 aa8.63□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 ABCB6Q9NP58 842 aa8.63□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 ARHGAP4P98171 946 aa8.62□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 PLCL1Q15111 1095 aa8.62□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 PIDD1Q9HB75 910 aa8.62□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 C8AP07357 584 aa8.61□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.61□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.61□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.6□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 PAPLNO95428 1278 aa8.6□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 SLFN14P0C7P3 912 aa8.6□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 CDK5R2Q13319 367 aa8.6□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 SPRED2Q7Z698 418 aa8.6□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.6□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.6□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.6□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 UNCXA6NJT0 531 aa8.59□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 FAM87AP0C7U9 286 aa8.59□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 JAG1P78504 1218 aa8.59□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 ID3Q02535 119 aa8.59□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 FAAP100Q0VG06 881 aa8.59□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 BNIP3Q12983 259 aa8.59□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.59□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 MISP3Q96FF7 219 aa8.59□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.59□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 CITED4Q96RK1 184 aa8.59□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.59□□□□□ -1.03
USP15-218ENST00000552346 ZNF862O60290 1169 aa8.58□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 NETO1Q8TDF5 533 aa8.58□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 TMC1Q8TDI8 760 aa8.58□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.58□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 BIN1O00499 593 aa8.57□□□□□ -1.04
USP15-218ENST00000552346 GPR182O15218 404 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms