RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	TMC4	Q7Z404	712 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	FAM161B	Q96MY7	647 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	RAD18	Q9NS91	495 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	HMX2	A2RU54	273 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF862	O60290	1169 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	LIG1	P18858	919 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	FST	P19883	344 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	SV2B	Q7L1I2	683 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	KCNB2	Q92953	911 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	BMP6	P22004	513 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	USP11	P51784	963 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	RASIP1	Q5U651	963 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	SLC51A	Q86UW1	340 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	SAMM50	Q9Y512	469 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MDM2-233	ENST00000545204	TMPRSS2	O15393	492 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	GSC2	O15499	205 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	SORBS3	O60504	671 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	IGLV1-40	P01703	118 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	CTSH	P09668	335 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	XP32	Q5T750	250 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	RNF43	Q68DV7	783 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	DYM	Q7RTS9	669 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	GIPC2	Q8TF65	315 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	CBX8	Q9HC52	389 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	TRIM37	O94972	964 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	SLFN14	P0C7P3	912 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	RXRB	P28702	533 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	ID3	Q02535	119 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	NFIA	Q12857	509 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	CRELD1	Q96HD1	420 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	RAB6A	P20340	208 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	ASPA	P45381	313 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC14	Q15048	493 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	MRS2	Q9HD23	443 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	DISC1	Q9NRI5	854 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	NFIC	P08651	508 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	ITGAE	P38570	1179 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	MAP7	Q14244	749 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	PAOX	Q6QHF9	649 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	RNF112	Q9ULX5	631 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	USP31	Q70CQ4	1352 aa		5.36	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	ERVK-24	P63145	666 aa		5.35	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
MDM2-233	ENST00000545204	NFKBIB	Q15653	356 aa		5.35	□□□□□ -1.55

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