RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537757.5

LMO3-217, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 516 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-217ENST00000537757 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 DOCK2Q92608 1830 aa14.87□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 SGSM2O43147 1006 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 PLCG2P16885 1265 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 EPHX2P34913 555 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 IL25Q9H293 177 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 RAD50Q92878 1312 aa14.86□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 GPAA1O43292 621 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 MBD4O95243 580 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 LCORLQ8N3X6 602 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 AIDAQ96BJ3 306 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 IDI2Q9BXS1 227 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 ARMT1Q9H993 441 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 USP40Q9NVE5 1235 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 WDR90Q96KV7 1748 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 FOXP2O15409 715 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 GNAT2P19087 354 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 CASC1Q6TDU7 716 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 RRAGCQ9HB90 399 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-217ENST00000537757 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 C8orf34Q49A92 452 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 PRKAB2O43741 272 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 MYO1BO43795 1136 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 ALX1Q15699 326 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 TEX11Q8IYF3 940 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 ENTPD3O75355 529 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 NFIAQ12857 509 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 VPS53Q5VIR6 699 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 FAM83AQ86UY5 434 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 CLRN2A0PK11 232 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 MAP4K1Q92918 833 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 ZMYM6O95789 1325 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 FLT1P17948 1338 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 CACNB3P54284 484 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 CNTNAP1P78357 1384 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 FAM151AQ8WW52 585 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 SCN4AP35499 1836 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 FGAP02671 866 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 PTH1RQ03431 593 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 TNFAIP1Q13829 316 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 SBK1Q52WX2 424 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 LDHDQ86WU2 507 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LMO3-217ENST00000537757 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms