RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 STK11IPQ8N1F8 1099 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR18Q9BV38 432 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 NPHS2Q9NP85 383 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 ICMTO60725 284 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 C8AP07357 584 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 LIG1P18858 919 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDK5R2Q13319 367 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDE3BQ13370 1112 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 ORC1Q13415 861 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMC1Q8TDI8 760 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1GALT1Q9NS00 363 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 BIN1O00499 593 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLFN14P0C7P3 912 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM87AP0C7U9 286 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITPKAP23677 461 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 POU5F2Q8N7G0 328 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 SERPINB4P48594 390 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 BNIP3Q12983 259 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF792Q3KQV3 632 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPRED2Q7Z698 418 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM181AQ8N9Y4 354 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMPRSS2O15393 492 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAPLNO95428 1278 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 JAG1P78504 1218 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 ID3Q02535 119 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 MISP3Q96FF7 219 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 ABCB6Q9NP58 842 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 NETO1Q8TDF5 533 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CRIM1Q9NZV1 1036 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAK1Q9UPV9 953 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 DTHD1Q6ZMT9 781 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNB2Q92953 911 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 NIF3L1Q9GZT8 377 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGAP4P98171 946 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP2R3AQ06190 1150 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAAP100Q0VG06 881 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTLL4Q14679 1199 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 PI4K2BQ8TCG2 481 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM129BQ96TA1 746 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJC25Q9H1X3 360 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF862O60290 1169 aa5.86□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD8BP10966 210 aa5.86□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD96P40200 585 aa5.86□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 FCGRTP55899 365 aa5.86□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 PKN1Q16512 942 aa5.86□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM168AQ92567 244 aa5.86□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CITED4Q96RK1 184 aa5.86□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 DISC1Q9NRI5 854 aa5.86□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP4R2Q9NY27 417 aa5.86□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 USTQ9Y2C2 406 aa5.86□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR182O15218 404 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 LEFTY1O75610 366 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITIH2P19823 946 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 FUT4P22083 530 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRM2Q14416 872 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF124Q15973 351 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ECM1Q16610 540 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 AOC3Q16853 763 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 HRASLS5Q96KN8 279 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1orf115Q9H7X2 142 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT82Q9NSB4 513 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 NLRP2Q9NX02 1062 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 VAV3Q9UKW4 847 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129 ms