RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 VAMP1P23763 118 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 DBN1Q16643 649 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 CSRNP1Q96S65 589 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 CHD4Q14839 1912 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 UTRNP46939 3433 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 ADGRB2O60241 1585 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.76□□□□□ -0.85
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HERC3-210ENST00000512194 ITGA6P23229 1130 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 TNP2Q05952 138 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 RALBP1Q15311 655 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 FBF1Q8TES7 1133 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 ELP3Q9H9T3 547 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 FAM83GA6ND36 823 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZNB5 142 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 NLRP13Q86W25 1043 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 EFCC1Q9HA90 598 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 CASZ1Q86V15 1759 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 SBF2Q86WG5 1849 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 ORC1Q13415 861 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 KRT28Q7Z3Y7 464 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.74□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 CCER2I3L3R5 266 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 BNIP3LO60238 219 aa9.73□□□□□ -0.85
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HERC3-210ENST00000512194 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 CCINQ13939 588 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 PMEPA1Q969W9 287 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 CAMKK2Q96RR4 588 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 GSX2Q9BZM3 304 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 MARK1Q9P0L2 795 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 PHF24Q9UPV7 400 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 MYOM1P52179 1685 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
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HERC3-210ENST00000512194 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.72□□□□□ -0.85
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HERC3-210ENST00000512194 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 SBNO1A3KN83 1393 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 ATP7BP35670 1465 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.71□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 PHACTR2O75167 634 aa9.71□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.71□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 PARP2Q9UGN5 583 aa9.71□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 NSD2O96028 1365 aa9.71□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 PPFIA3O75145 1194 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 DAB2P98082 770 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 TMC4Q7Z404 712 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 MORC1Q86VD1 984 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 STRN4Q9NRL3 753 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 BTG4Q9NY30 223 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.7□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PP64 1363 aa9.69□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 ARHGEF10O15013 1369 aa9.69□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 ACEP12821 1306 aa9.69□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.69□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.69□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 PEAK1Q9H792 1746 aa9.69□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.68□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 SASH3O75995 380 aa9.68□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 TRIM37O94972 964 aa9.68□□□□□ -0.86
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