RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 LMNB2Q03252 620 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 AP3B2Q13367 1082 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 SEPT6Q14141 434 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 CORO1BQ9BR76 489 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 USP26Q9BXU7 913 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 NLRP12P59046 1061 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 POU4F3Q15319 338 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 XP32Q5T750 250 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 RASIP1Q5U651 963 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 RHOVQ96L33 236 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 UBP1Q9NZI7 540 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 ATP2B1P20020 1258 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 MAOBP27338 520 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 APOBRQ0VD83 1088 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 DOC2BQ14184 412 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 PDE3AQ14432 1141 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 WNT8BQ93098 351 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 BPNT1O95861 308 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 F13A1P00488 732 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 NID1P14543 1247 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 MCM4P33991 863 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 SETDB1Q15047 1291 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 SEZ6Q53EL9 994 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 NKD1Q969G9 470 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 ECEL1O95672 775 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 GJA8P48165 433 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 RAC1P63000 192 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 FBXO27Q8NI29 283 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 FAM229AH3BQW9 127 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 GREM1O60565 184 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 GARTP22102 1010 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 GATA4P43694 442 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 PDZD3Q86UT5 571 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 SPATA32Q96LK8 384 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 RAD18Q9NS91 495 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 GINM1Q9NU53 330 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM37O94972 964 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 LIG1P18858 919 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 ITGB7P26010 798 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 CRKP46108 304 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 UBXN4Q92575 508 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 A0A0A0MRY4 1105 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-215ENST00000498054 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-215ENST00000498054 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-215ENST00000498054 Q8N3U1 123 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-215ENST00000498054 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-215ENST00000498054 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-215ENST00000498054 GMLQ99445 158 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-215ENST00000498054 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-215ENST00000498054 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-215ENST00000498054 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-215ENST00000498054 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-215ENST00000498054 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms