RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488117.5

C9orf72-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 72, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf72, Length 4,808 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72-205ENST00000488117 PCP11498 1178 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 LIG1P18858 919 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 GSDMDP57764 484 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 AKNAD1Q5T1N1 836 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 SUSD4Q5VX71 490 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 ANO1Q5XXA6 986 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 KANK3Q6NY19 840 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 STOX1Q6ZVD7 989 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 PRIMPOLQ96LW4 560 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 MTA3Q9BTC8 594 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 ZNF287Q9HBT7 754 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 RCOR1Q9UKL0 485 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 DISP2A7MBM2 1401 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 ATRNO75882 1429 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 TJP1Q07157 1748 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 SMC2O95347 1197 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 DEXIO95424 95 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 CDC25BP30305 580 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 CHRNDQ07001 517 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 PDE4BQ07343 736 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 UBE4AQ14139 1066 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 ADALQ6DHV7 355 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 FAM173BQ6P4H8 233 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 TPTE2Q6XPS3 522 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 FBXW7Q969H0 707 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 DNAJC25Q9H1X3 360 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 CBX8Q9HC52 389 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 POLR3EQ9NVU0 708 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 MRVI1Q9Y6F6 885 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 RIC1Q4ADV7 1423 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 EP400Q96L91 3159 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 RGL2O15211 777 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 CUTAO60888 179 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 LDHCP07864 332 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 SYKP43405 635 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 CTDSPL2Q05D32 466 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 PPARAQ07869 468 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 CERS3Q8IU89 383 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 SLF2Q8IX21 1173 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 AGXT2Q9BYV1 514 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 WWC3Q9ULE0 1092 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 UTRNP46939 3433 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 STK36Q9NRP7 1315 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa3.06□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 MYO1BO43795 1136 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 NR1I2O75469 434 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 BAG3O95817 575 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 TPM1P09493 284 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 KIF5BP33176 963 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 RFC4P35249 363 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 TXLNAP40222 546 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 USP5P45974 858 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 ZNF75DP51815 510 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 RCAN1P53805 252 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 EIF5P55010 431 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 ST5P78524 1137 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 ST3GAL1Q11201 340 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 MYSM1Q5VVJ2 828 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 ZNF804AQ7Z570 1209 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 LUZP1Q86V48 1076 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 CCDC150Q8NCX0 1101 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 PIBF1Q8WXW3 757 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 C8orf37Q96NL8 207 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 USP28Q96RU2 1077 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 G3V3G9 751 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 DYNC1I1O14576 645 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 PPP6R2O75170 966 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 CAMTA2O94983 1202 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 KRT2P35908 639 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 LIFRP42702 1097 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 NT5C2P49902 561 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 RASGRF1Q13972 1273 aa3.05□□□□□ -1.92
C9orf72-205ENST00000488117 RILPL1Q5EBL4 403 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms