RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPP4CP60510 307 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LDHDQ86WU2 507 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BAG3O95817 575 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POTEIP0CG38 1075 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POTEJP0CG39 1038 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLCG2P16885 1265 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SDSP20132 328 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RGS3P49796 1198 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RHBDL3P58872 404 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 APPBP2Q92624 585 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GGA3Q9NZ52 723 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCN4AP35499 1836 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TOMM70O94826 608 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHGBP05060 677 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHADLQ6NUI6 762 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RILPL2Q969X0 211 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IDI2Q9BXS1 227 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 USP40Q9NVE5 1235 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AKAP11Q9UKA4 1901 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAST2Q6P0Q8 1798 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HIP1O00291 1037 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TNFAIP1Q13829 316 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM83AQ86UY5 434 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OSBP2Q969R2 916 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMOD2Q9NZR1 351 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLRN2A0PK11 232 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ENTPD3O75355 529 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MBD4O95243 580 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C1QTNF8P60827 252 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NFIAQ12857 509 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SULF1Q8IWU6 871 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMC1BQ8NDV3 1235 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AIDAQ96BJ3 306 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A0D9SFI3 127 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GNAT2P19087 354 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHMLP26374 656 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TNNI2P48788 182 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CACNB3P54284 484 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FSTL1Q12841 308 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRT26Q7Z3Y9 468 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TEX11Q8IYF3 940 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LCORLQ8N3X6 602 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM151AQ8WW52 585 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM227BQ96M60 508 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VEZTQ9HBM0 779 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CNTNAP1P78357 1384 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DOCK2Q92608 1830 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FLT1P17948 1338 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAD50Q92878 1312 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADM5C9JUS6 153 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 M0R2C6 588 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPAA1O43292 621 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RASA3Q14644 834 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TEPSINQ96N21 525 aa9.81□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms