RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407637.5

HERC3-203, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 2,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-203ENST00000407637 FSD1Q9BTV5 496 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 LAMA4Q16363 1823 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CHUKO15111 745 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 STIM1Q13586 685 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 XAGE2Q96GT9 111 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.58□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 HIP1O00291 1037 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 GNGT1P63211 74 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 TUBB4BP68371 445 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 TEX11Q8IYF3 940 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 COG3Q96JB2 828 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 SNRKQ9NRH2 765 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 PNOCQ13519 176 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 AACSQ86V21 672 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.57□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 KIF3CO14782 793 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 SPTLC2O15270 562 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 JCADQ9P266 1359 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 TUBBP07437 444 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 INHBEP58166 350 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 PIP4K2BP78356 416 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 PPFIA1Q13136 1202 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 IDI1Q13907 227 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 KRT32Q14532 448 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 IQCA1Q86XH1 822 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 COG1Q8WTW3 980 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CHD1O14646 1710 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 MYH8P13535 1937 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 AGPSO00116 658 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 KIAA0754O94854 1291 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 FSBPO95073 299 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 TUBB2AQ13885 445 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 TAF5LO75529 589 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 PDE4BQ07343 736 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 OLFM4Q6UX06 510 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CPS1P31327 1500 aa14.55□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 COL15A1P39059 1388 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 ALDH1L1O75891 902 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 ABL1P00519 1130 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 KCNA4P22459 653 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CDC27P30260 824 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 ZMYND10O75800 440 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.54□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 GGT6Q6P531 493 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CENPHQ9H3R5 247 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 YEATS4O95619 227 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 KLC4Q9NSK0 619 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.53□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
HERC3-203ENST00000407637 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms