RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 LDHCP07864 332 aa23.75■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 FGD1P98174 961 aa23.75■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.75■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 MTFR1LQ9H019 292 aa23.75■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 NBPF3Q9H094 633 aa23.75■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.75■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.74■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 G3V3G9 751 aa23.74■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 LARGE1O95461 756 aa23.74■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 POLD1P28340 1107 aa23.74■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 TRDNQ13061 729 aa23.74■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.74■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.74■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 MRE11P49959 708 aa23.73■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 ME3Q16798 604 aa23.73■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.73■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.73■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.73■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.397e-7■■■■■ 63.9
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 TTLL6Q8N841 843 aa23.73■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.73■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.392e-7■■■■□ 21.5
SUMO3-201ENST00000332859 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.72■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 MCM5P33992 734 aa23.72■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 GTF2IP78347 998 aa23.72■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 GRIK5Q16478 980 aa23.72■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.72■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 DOK7Q18PE1 504 aa23.71■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 SLF2Q8IX21 1173 aa23.71■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.71■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.71■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 BAG3O95817 575 aa23.7■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 DPEP1P16444 411 aa23.7■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 CERS3Q8IU89 383 aa23.7■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.7■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 FBXL16Q8N461 479 aa23.7■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 BRF1Q92994 677 aa23.7■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.7■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.7■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.7■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.7■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 SNED1Q8TER0 1413 aa23.7■■□□□ 1.39
SUMO3-201ENST00000332859 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.7■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.7■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 PRC1O43663 620 aa23.69■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.69■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 PODNQ7Z5L7 613 aa23.69■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 FBXW7Q969H0 707 aa23.69■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.69■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 PPP4CP60510 307 aa23.68■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.68■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 PPARAQ07869 468 aa23.68■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.68■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.68■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.68■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 C21orf2O43822 256 aa23.68■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 TGFB2P61812 414 aa23.68■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC93Q567U6 631 aa23.68■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 KRT23Q9C075 422 aa23.68■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 CHD4Q14839 1912 aa23.67■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 NEDD4P46934 1319 aa23.67■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 KCNA3P22001 575 aa23.67■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 ST3GAL1Q11201 340 aa23.67■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.67■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 CHST3Q7LGC8 479 aa23.67■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 NECAB1Q8N987 351 aa23.67■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 ANTXR2P58335 489 aa23.66■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.66■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.66■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.66■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.66■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.66■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 B4E1Z4 1266 aa23.65■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 MBD3O95983 291 aa23.65■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 APOBRQ0VD83 1088 aa23.65■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.65■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 GTF3C6Q969F1 213 aa23.65■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 GAKO14976 1311 aa23.64■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.64■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 ECE2O60344 883 aa23.64■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 PLCG2P16885 1265 aa23.64■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 BTDP43251 543 aa23.64■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 STK3Q13188 491 aa23.64■■□□□ 1.38
SUMO3-201ENST00000332859 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms