RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 ALG1Q9BT22 464 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 GREM2Q9H772 168 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 SGMS1Q86VZ5 419 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 VPS37DQ86XT2 251 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 PTPAQ15257 358 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 KRT40Q6A162 431 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 IFNKQ9P0W0 207 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 NID2Q14112 1375 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 STK36Q9NRP7 1315 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 DMTNQ08495 405 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 PDE8BO95263 885 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 PDE6AP16499 860 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 CBX1P83916 185 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 NTRK3Q16288 839 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 FBXW7Q969H0 707 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 MAP3K14Q99558 947 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 SMC2O95347 1197 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 SYKP43405 635 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 ARMCX5Q6P1M9 558 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 KIF18AQ8NI77 898 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 PIGBQ92521 554 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 STRCQ7RTU9 1775 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF532Q9HCE3 1301 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 SYNE4Q8N205 404 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 DOCK2Q92608 1830 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 MYO1BO43795 1136 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 TUBB4AP04350 444 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 CDC27P30260 824 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 HLFQ16534 295 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 RESP18Q5W5W9 173 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 SHC4Q6S5L8 630 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF592Q92610 1267 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 AIFM3Q96NN9 605 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB43O43298 467 aa26.06■■□□□ 1.76
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HOXD1-201ENST00000331462 CCDC102BQ68D86 513 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 TMC6Q7Z403 805 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 ERO1AQ96HE7 468 aa26.06■■□□□ 1.76
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HOXD1-201ENST00000331462 HSD3B7Q9H2F3 369 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 LY9Q9HBG7 655 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 BIN1O00499 593 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 OGFRQ9NZT2 677 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 ITGB4P16144 1822 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 B4E1Z4 1266 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 NRDCO43847 1150 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 CUTAO60888 179 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 FGFR2P21802 821 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 FANCCQ00597 558 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 PDE8AO60658 829 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 GPTP24298 496 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 PHKA1P46020 1223 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 L2HGDHQ9H9P8 463 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 MICU3Q86XE3 530 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 LPIN2Q92539 896 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 SENP2Q9HC62 589 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 APPP05067 770 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 MYL5Q02045 173 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM29Q14134 588 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD1-201ENST00000331462 PHKBQ93100 1093 aa26.02■■□□□ 1.76
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