RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 CCDC66A2RUB6 948 aa29.15■■■□□ 2.26
SENP3-201ENST00000321337 CHMP4CQ96CF2 233 aa29.15■■■□□ 2.26
SENP3-201ENST00000321337 MAP3K14Q99558 947 aa29.15■■■□□ 2.26
SENP3-201ENST00000321337 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
SENP3-201ENST00000321337 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa29.15■■■□□ 2.26
SENP3-201ENST00000321337 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.14■■■□□ 2.26
SENP3-201ENST00000321337 TMEM51Q9NW97 253 aa29.14■■■□□ 2.26
SENP3-201ENST00000321337 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.14■■■□□ 2.26
SENP3-201ENST00000321337 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa29.14■■■□□ 2.26
SENP3-201ENST00000321337 ZNF213O14771 459 aa29.14■■■□□ 2.26
SENP3-201ENST00000321337 TIGD1Q96MW7 591 aa29.14■■■□□ 2.26
SENP3-201ENST00000321337 GPAA1O43292 621 aa29.13■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 CHRNA2Q15822 529 aa29.13■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa29.13■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D10CQ8IV04 446 aa29.13■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.13■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 TRERF1Q96PN7 1200 aa29.13■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 MYL10Q9BUA6 226 aa29.13■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.12■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 INCENPQ9NQS7 918 aa29.12■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 ADKP55263 362 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 CCDC158Q5M9N0 1113 aa29.11■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 RESP18Q5W5W9 173 aa29.11■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 PDILTQ8N807 584 aa29.11■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 APPBP2Q92624 585 aa29.11■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 C4AP0C0L4 1744 aa29.1■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 C4BP0C0L5 1744 aa29.1■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 GLI3P10071 1580 aa29.1■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 CBFA2T2O43439 604 aa29.1■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 TUBB4AP04350 444 aa29.1■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 GRIN1Q05586 938 aa29.1■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 MICU3Q86XE3 530 aa29.1■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 ZNF827Q17R98 1081 aa29.1■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 STK11IPQ8N1F8 1099 aa29.1■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 CPDO75976 1380 aa29.1■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 CCP110O43303 1012 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D8O95759 1140 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 GNG11P61952 73 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.252e-7■■■■■ 26.8
SENP3-201ENST00000321337 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 NEK11Q8NG66 645 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 DESI2Q9BSY9 194 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 TJP1Q07157 1748 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 ZMYM6O95789 1325 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 EFCAB8A8MWE9 144 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 PPP6R2O75170 966 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 CIAO1O76071 339 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 ST5P78524 1137 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 KRBA2Q6ZNG9 492 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 CNNM3Q8NE01 707 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 ZBTB9Q96C00 473 aa29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 OLFM4Q6UX06 510 aa29.08■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 CCDC34Q96HJ3 373 aa29.08■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 KCNH3Q9ULD8 1083 aa29.08■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 TMEM94Q12767 1356 aa29.08■■■□□ 2.25
SENP3-201ENST00000321337 PRR29P0C7W0 189 aa29.07■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 TEX35Q5T0J7 233 aa29.07■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa29.07■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.07■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 B4E1Z4 1266 aa29.07■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 ARHGAP6O43182 974 aa29.07■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 TC2NQ8N9U0 490 aa29.07■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 APOA5Q6Q788 366 aa29.06■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 TICAM2Q86XR7 235 aa29.06■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa29.06■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 MTF1Q14872 753 aa29.06■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 KARSQ15046 597 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 CCDC102BQ68D86 513 aa29.06■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 MED15Q96RN5 788 aa29.06■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 ZSCAN12O43309 604 aa29.05■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 CASQ1P31415 396 aa29.05■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 MAP3K9P80192 1104 aa29.05■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 CCDC57Q2TAC2 916 aa29.05■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 A0A0U1RQJ8 604 aa29.05■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 CCDC191Q8NCU4 936 aa29.05■■■□□ 2.24
SENP3-201ENST00000321337 ATRIPQ8WXE1 791 aa29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms