RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306888.6

LNX1-202, Transcript of ligand of numb-protein X 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LNX1, Length 3,757 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX1-202ENST00000306888 LRP2BPQ9P2M1 347 aa9□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 NEDD4P46934 1319 aa9□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 STK36Q9NRP7 1315 aa9□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 ROBO3Q96MS0 1386 aa9□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 PTPDC1A2A3K4 754 aa9□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 SERPINB2P05120 415 aa9□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 NAPBQ9H115 298 aa9□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 GRPEL1Q9HAV7 217 aa9□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 EP400Q96L91 3159 aa9□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 MYH2Q9UKX2 1941 aa9□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 TRIM37O94972 964 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 IL1R1P14778 569 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 DDR1Q08345 913 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 CYB5R4Q7L1T6 521 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 ARMT1Q9H993 441 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 LY9Q9HBG7 655 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 JAK2O60674 1132 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 ATP2B4P23634 1241 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 KRT85P78386 507 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 SBK1Q52WX2 424 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 FDPSP14324 419 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 CYP7A1P22680 504 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.99□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 PHF14O94880 888 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 KLRK1P26718 216 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 HAND2P61296 217 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 PPP2R5BQ15173 497 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 TMTC2Q8N394 836 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 PSME4Q14997 1843 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 FGD1P98174 961 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 PPP4CP60510 307 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 PPARAQ07869 468 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 STK3Q13188 491 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 APOA5Q6Q788 366 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 VPS37DQ86XT2 251 aa8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 MYH6P13533 1939 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 ORC4O43929 436 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 CDKL5O76039 1030 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 MECOMQ03112 1051 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 C10orf71Q711Q0 1435 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 NTRK3Q16288 839 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 SP8Q8IXZ3 490 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 ZNF827Q17R98 1081 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 CCDC183Q5T5S1 534 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 CFAP45Q9UL16 551 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.97□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 GOLGA8BA8MQT2 603 aa8.96□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 PRKAB2O43741 272 aa8.96□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 PLCB2Q00722 1185 aa8.96□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 SEC23AQ15436 765 aa8.96□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.96□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 RAI14Q9P0K7 980 aa8.96□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.96□□□□□ -0.97
LNX1-202ENST00000306888 B4E1Z4 1266 aa8.96□□□□□ -0.98
LNX1-202ENST00000306888 APPP05067 770 aa8.96□□□□□ -0.98
LNX1-202ENST00000306888 GSTO1P78417 241 aa8.96□□□□□ -0.98
LNX1-202ENST00000306888 GPSM2P81274 684 aa8.96□□□□□ -0.98
LNX1-202ENST00000306888 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
LNX1-202ENST00000306888 TTC6Q86TZ1 520 aa8.96□□□□□ -0.98
LNX1-202ENST00000306888 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.96□□□□□ -0.98
LNX1-202ENST00000306888 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
LNX1-202ENST00000306888 SNED1Q8TER0 1413 aa8.96□□□□□ -0.98
LNX1-202ENST00000306888 TDO2P48775 406 aa8.96□□□□□ -0.98
LNX1-202ENST00000306888 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
LNX1-202ENST00000306888 CHST3Q7LGC8 479 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.9 ms