RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292377.3

GPC2-201, Transcript of glypican 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC2, Length 2,532 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2-201ENST00000292377 TOMM22Q9NS69 142 aa21.39■■□□□ 1.02
GPC2-201ENST00000292377 CDC27P30260 824 aa21.39■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 TM4SF1P30408 202 aa21.39■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.39■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 ESPNB1AK53 854 aa21.38■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.38■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 NR1I2O75469 434 aa21.38■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.38■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.38■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.38■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 PDLIM2Q96JY6 352 aa21.38■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 NHSQ6T4R5 1651 aa21.38■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 APOA5Q6Q788 366 aa21.37■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 BICD2Q8TD16 824 aa21.37■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 PHKBQ93100 1093 aa21.37■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 LY9Q9HBG7 655 aa21.37■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.37■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.37■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.37■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 KIF3AQ9Y496 699 aa21.37■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.36■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.36■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.36■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 NFIXQ14938 502 aa21.36■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 C8orf76Q96K31 380 aa21.36■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 A0A1B0GUL6 1792 aa21.36■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.36■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.36■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 MPNDQ8N594 471 aa21.35■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.35■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 CFAP45Q9UL16 551 aa21.35■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.35■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 EVX2Q03828 476 aa21.35■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.35■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.34■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 KIF28PB7ZC32 967 aa21.34■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.34■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 CERKQ8TCT0 537 aa21.34■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 USP25Q9UHP3 1055 aa21.34■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.34■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 ZMYM6O95789 1325 aa21.34■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.33■■□□□ 1.01
GPC2-201ENST00000292377 ZBTB43O43298 467 aa21.33■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 TMEM87BQ96K49 555 aa21.33■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 SBF2Q86WG5 1849 aa21.33■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 GNAT2P19087 354 aa21.32■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 PPARAQ07869 468 aa21.32■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 TNMDQ9H2S6 317 aa21.32■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 PRDX5P30044 214 aa21.32■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.32■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 RGL2O15211 777 aa21.31■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 MAP3K11Q16584 847 aa21.31■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.31■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.31■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 CLIC4Q9Y696 253 aa21.31■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 CACNA1SQ13698 1873 aa21.31■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 C4AP0C0L4 1744 aa21.31■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 C4BP0C0L5 1744 aa21.31■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.31■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 MECOMQ03112 1051 aa21.31■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 CHD4Q14839 1912 aa21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 PRDM1O75626 825 aa21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 NTRK3Q16288 839 aa21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 ALG1Q9BT22 464 aa21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 LY75O60449 1722 aa21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 KRT23Q9C075 422 aa21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 ME1P48163 572 aa21.29■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 PLCB2Q00722 1185 aa21.29■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 CNBD1Q8NA66 436 aa21.29■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.29■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
GPC2-201ENST00000292377 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms