RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 NCOA7Q8NI08 942 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 COA1Q9GZY4 146 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM205AQ6ZU69 1335 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNA3P22001 575 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 NACAP1Q9BZK3 213 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 IGSF3O75054 1194 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 TDO2P48775 406 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB7AO95365 584 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 NUCB2P80303 420 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 PRC1O43663 620 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 MCM5P33992 734 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 GTF2IP78347 998 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 APOBRQ0VD83 1088 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 STK3Q13188 491 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 DOK7Q18PE1 504 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 CYB5R4Q7L1T6 521 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 EVCP57679 992 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 SCN9AQ15858 1988 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 B4E1Z4 1266 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 EVX2Q03828 476 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 CERS5Q8N5B7 392 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 GTF3C6Q969F1 213 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 PPARAQ07869 468 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 AKNAD1Q5T1N1 836 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC17AQ6ZS10 378 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 STAG1Q8WVM7 1258 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR19Q8NEZ3 1342 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 BRD1O95696 1058 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 MCM4P33991 863 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 FGD1P98174 961 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 SCRN1Q12765 414 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 CTR9Q6PD62 1173 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNQ5Q9NR82 932 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 DPEP1P16444 411 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 MXD3Q9BW11 206 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 SMC3Q9UQE7 1217 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 C21orf2O43822 256 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 PFKFB2O60825 505 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 GJB2P29033 226 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP4CP60510 307 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 TRDNQ13061 729 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 EYA3Q99504 573 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 DBNDD1Q9H9R9 158 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSWIM5Q9P217 1185 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 MINDY4BA8MYZ0 360 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 GSTO1P78417 241 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 USP17L12C9JPN9 530 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 USP17L21D6R901 530 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 STK11IPQ8N1F8 1099 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 SENP2Q9HC62 589 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 LAMB1P07942 1786 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 UTRNP46939 3433 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 KDM4AO75164 1064 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SYT1P21579 422 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 TTLL6Q8N841 843 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 CTDNEP1O95476 244 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PODNQ7Z5L7 613 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 CHAMP1Q96JM3 812 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 MTFR1LQ9H019 292 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 GAKO14976 1311 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 JAK2O60674 1132 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 CNNM2Q9H8M5 875 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 BAG4O95429 457 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 LDHCP07864 332 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms