RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 CALML3P27482 149 aa24.64■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 ARID5AQ03989 594 aa24.64■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 ADALQ6DHV7 355 aa24.64■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.64■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.63■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 KCNJ14Q9UNX9 436 aa24.63■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 TAF5LO75529 589 aa24.63■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 GNAQP50148 359 aa24.63■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 TACC1O75410 805 aa24.63■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 CUTAO60888 179 aa24.62■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 KRT83P78385 493 aa24.62■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 A0A087WWV3 80 aa24.62■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.62■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 RTL9Q8NET4 1388 aa24.62■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 STAMQ92783 540 aa24.62■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.62■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 CALM1P0DP23 149 aa24.62■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 CALM2P0DP24 149 aa24.62■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 CALM3P0DP25 149 aa24.62■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
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USP12-201ENST00000282344 DEXIO95424 95 aa24.61■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 MTX1Q13505 466 aa24.61■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.61■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.61■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 ARHGAP6O43182 974 aa24.61■■□□□ 1.53
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USP12-201ENST00000282344 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.6■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.6■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.6■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 PFKFB2O60825 505 aa24.6■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 PNOCQ13519 176 aa24.6■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa24.6■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 KDRP35968 1356 aa24.6■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 PTCH1Q13635 1447 aa24.6■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 PFKFB1P16118 471 aa24.6■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.6■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.6■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 ANKRD62A6NC57 917 aa24.59■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 SLF2Q8IX21 1173 aa24.59■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 MLKLQ8NB16 471 aa24.59■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 HSF2BPO75031 334 aa24.59■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 CYP21A2P08686 494 aa24.59■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.59■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 SCRN1Q12765 414 aa24.59■■□□□ 1.53
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USP12-201ENST00000282344 CTNND2Q9UQB3 1225 aa24.58■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.58■■□□□ 1.53
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USP12-201ENST00000282344 LRRC8AQ8IWT6 810 aa24.58■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.58■■□□□ 1.53
USP12-201ENST00000282344 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.58■■□□□ 1.52
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USP12-201ENST00000282344 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.58■■□□□ 1.52
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USP12-201ENST00000282344 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.57■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.57■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.525e-6■□□□□ 9.5
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USP12-201ENST00000282344 POSTNQ15063 836 aa24.56■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.56■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 HAUS7Q99871 368 aa24.56■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 IVLP07476 585 aa24.56■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 ADKP55263 362 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.56■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.56■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.522e-6■■■■■ 96.1
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USP12-201ENST00000282344 LRRC24Q50LG9 513 aa24.56■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa24.56■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 KIAA1524Q8TCG1 905 aa24.56■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.56■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 KIF2CQ99661 725 aa24.56■■□□□ 1.52
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USP12-201ENST00000282344 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.55■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 PREX2Q70Z35 1606 aa24.55■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 FGAP02671 866 aa24.55■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 KRT9P35527 623 aa24.54■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.54■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 SETDB2Q96T68 719 aa24.54■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 COPRSQ9NQ92 184 aa24.54■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.54■■□□□ 1.52
USP12-201ENST00000282344 F8W031 263 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
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