RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	CCL21	O00585	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ASIP	P42127	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	COL4A1	P02462	1669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PAX4	O43316	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	LOXL3	P58215	753 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ERVK-16	P61578	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PLGLB1	Q02325	96 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	FOXB1	Q99853	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	SYNGR2	O43760	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PYY	P10082	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	HCST	Q9UBK5	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	SBF1	O95248	1867 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	FOXC1	Q12948	553 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072		R4GMQ9	66 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072		K7ENP7	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	OVOL3	O00110	214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PRRG2	O14669	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	WDR90	Q96KV7	1748 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	GHRH	P01286	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	RBP4	P02753	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	STATH	P02808	62 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PTPRD	P23468	1912 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	WISP1	O95388	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TCRA	P04437	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072		V9GYV3	84 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A0A6YYD4	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	RRH	O14718	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	EDDM3B	P56851	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6ZQT7	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	PLXNA3	P51805	1871 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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