RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 C17orf77Q96MU5 243 aa16.81■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 Q9H3A6 140 aa16.81■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 A0A1W2PPR1 153 aa16.81■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 IZUMO1RA6ND01 250 aa16.81■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 TCF24Q7RTU0 167 aa16.81■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 C8orf46Q8TAG6 207 aa16.81■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 NEU1Q99519 415 aa16.81■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 CBLN4Q9NTU7 201 aa16.81■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 IGKV1-17P01599 117 aa16.8■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 PMCHP20382 165 aa16.8■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 CAMPP49913 170 aa16.8■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 HES1Q14469 280 aa16.8■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM183BQ1AE95 376 aa16.8■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 FAM19A2Q8N3H0 131 aa16.8■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 LY6G5BQ8NDX9 201 aa16.8■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF253O75346 499 aa16.8■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 HTR1DP28221 377 aa16.8■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 Q0VG73 95 aa16.8■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.8■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF586Q9NXT0 402 aa16.8■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 FBXL7Q9UJT9 491 aa16.8■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa16.79■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 HIGD1CA8MV81 97 aa16.79■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 VN1R17PQ8TDU5 208 aa16.79■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM68Q96MH6 324 aa16.79■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 HIGD1AQ9Y241 93 aa16.79■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 K7EIM0 57 aa16.79■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 WDR73Q6P4I2 378 aa16.79■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 APCSP02743 223 aa16.78■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 CFHR4Q92496 578 aa16.78■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 RASL11BQ9BPW5 248 aa16.78■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 NDUFAF3Q9BU61 184 aa16.78■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 RAB1BQ9H0U4 201 aa16.78■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 EREGO14944 169 aa16.78■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 ESDP10768 282 aa16.78■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 KLRB1Q12918 225 aa16.78■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 DPM3Q9P2X0 92 aa16.78■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 A0A1W2PS18 150 aa16.77■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 RNF224P0DH78 156 aa16.77■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 LINC00469Q8N7U9 141 aa16.77■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TMEM260-216ENST00000557657 KRTDAPP60985 99 aa16.77■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 PAFAH1B2P68402 229 aa16.77■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 STXBP6Q8NFX7 210 aa16.77■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 GRAMD2BQ96HH9 432 aa16.77■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 MT-ND6P03923 174 aa16.76■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 TCRAP04437 139 aa16.76■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 GPX1P07203 203 aa16.76■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 FAM231DQ6ZW35 169 aa16.76■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 LOC105371242A0A075B767 164 aa16.76■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 NBR2O15453 112 aa16.76■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 AMTP48728 403 aa16.76■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 GPR82Q96P67 336 aa16.76■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 ATG101Q9BSB4 218 aa16.76■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 PAM16Q9Y3D7 125 aa16.76■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 IGHV3-23P01764 117 aa16.75■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 HLA-DQA1P01909 254 aa16.75■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 BRS3P32247 399 aa16.75■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 LY6DQ14210 128 aa16.75■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 C11orf71Q6IPW1 123 aa16.75■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa16.75■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 MLST8Q9BVC4 326 aa16.75■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 KLF12Q9Y4X4 402 aa16.75■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 NDPQ00604 133 aa16.75■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 C1orf194Q5T5A4 169 aa16.75■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 C5orf17Q8NAS9 161 aa16.75■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 PLP1P60201 277 aa16.74■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa16.74■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 GTSF1Q8WW33 167 aa16.74■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 NTF3P20783 257 aa16.74■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 OR11H6Q8NGC7 330 aa16.74■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 TSKUQ8WUA8 353 aa16.74■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 TIMD4Q96H15 378 aa16.74■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 NRN1Q9NPD7 142 aa16.74■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 OR2D3Q8NGH3 330 aa16.73■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 C18orf32Q8TCD1 76 aa16.73■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 LTAP01374 205 aa16.72■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 RPL19P84098 196 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 PRNTQ86SH4 94 aa16.72■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 KCNS1Q96KK3 526 aa16.72■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 PGLYRP4Q96LB8 373 aa16.72■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa16.72■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa16.72■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 TOMM40O96008 361 aa16.72■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 IL4P05112 153 aa16.72■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 KIR2DL5AQ8N109 375 aa16.72■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 Q8N976 141 aa16.72■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 OR10J3Q5JRS4 329 aa16.71■□□□□ 0.27
TMEM260-216ENST00000557657 VMO1Q7Z5L0 202 aa16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms