RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 IFNA21P01568 189 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 MITD1Q8WV92 249 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 SMIM8Q96KF7 97 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 MUC4Q99102 2169 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 KNCNA6PVL3 124 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 FNDC10F2Z333 226 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 TAS2R30P59541 319 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 PSMG4Q5JS54 123 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 MFFQ9GZY8 342 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 H3BMM0 161 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 SOCS3O14543 225 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 MIFP14174 115 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 PAX9P55771 341 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 LYZP61626 148 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 C4orf46Q504U0 113 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 Q8NAQ8 132 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 CCDC32Q9BV29 185 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 HRH4Q9H3N8 390 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 A0A1B0GVY2 172 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 ISLRO14498 428 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 LYRM1O43325 122 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 TCRBP04435 133 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 MED14OSP0DP75 135 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 HLA-DRB4P13762 266 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 C4BPBP20851 252 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 S100A7P31151 101 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 ID1P41134 155 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 PSMB3P49720 205 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 OR2F1Q13607 317 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 GPR82Q96P67 336 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 PSENENQ9NZ42 101 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 APLNQ9ULZ1 77 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 X6R8D5 127 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-221ENST00000550734 ZNF98A6NK75 572 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 H3BP45 60 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 K7EPK0 472 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 TSC22D2O75157 780 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 MEOX2P50222 304 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 PLP1P60201 277 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 SELENOTP62341 195 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 DLK1P80370 383 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 SSSCA1O60232 199 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 GALR1P47211 349 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 AKR1C1Q04828 323 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 C17orf77Q96MU5 243 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 GGACTQ9BVM4 153 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 C7orf66A4D0T2 115 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 A8MTW9 85 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 S100ZQ8WXG8 99 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-221ENST00000550734 NEU1Q99519 415 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms