RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491160.1

PBX3-208, Transcript of PBX homeobox 3, human

TSL 5

Gene PBX3, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PBX3-208	ENST00000491160	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	MUC4	Q99102	2169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	IL3RA	P26951	378 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF134	P52741	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	LINC00205	P59089	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CCL20	P78556	96 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	DLK1	P80370	383 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	MMD	Q15546	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	RARRES2	Q99969	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	MPDU1	O75352	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	IFNA4	P05014	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	NPY1R	P25929	384 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	AKR1C3	P42330	323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	PSMB3	P49720	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	NDP	Q00604	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160		H3BQ15	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	UPK2	O00526	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	FCN1	O00602	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CYB5B	O43169	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	PROP1	O75360	226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	OR2C1	O95371	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	HLA-DRB1	P01911	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	FOLR2	P14207	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	CTRB1	P17538	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	TPPP2	P59282	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PBX3-208	ENST00000491160	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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