RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	RLN1	P04808	185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	HTN1	P15515	57 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	F2R	P25116	425 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SNCA	P37840	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	ID1	P41134	155 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	ASIP	P42127	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	RAB14	P61106	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	MSMO1	Q15800	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	NEDD8	Q15843	81 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504		Q8WTZ3	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504		F8W036	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	WRB	O00258	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SSX5	O60225	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	RAB6A	P20340	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	OPRK1	P41145	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PAX9	P55771	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	OR10A3	P58181	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	DHODH	Q02127	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF79	Q15937	498 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	MCFD2	Q8NI22	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504		M0R2Z0	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PAX4	O43316	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	BUB3	O43684	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	IFNA7	P01567	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	IL4	P05112	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	HOXA5	P20719	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	RAB4B	P61018	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	HERV-K104	P61576	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	CYGB	Q8WWM9	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC01587	Q99440	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	MND1	Q9BWT6	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A0J9YX75	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	NXPH4	O95158	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	INS	P01308	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	S100A8	P05109	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TSPO	P30536	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PSMB3	P49720	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SPHAR	Q15513	63 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	IFITM5	A6NNB3	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	CORT	O00230	105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	PDCD5	O14737	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	GAGE7	O76087	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	SMIM6	P0DI80	62 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HDLBP-222	ENST00000449504	UCP1	P25874	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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