RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339298.2

SOCS4-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS4, Length 6,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 C9orf85Q96MD7 179 aa2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 REG4Q9BYZ8 158 aa2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 MAP6D1Q9H9H5 199 aa2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 J3QQQ9 107 aa2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 SLC25A20O43772 301 aa2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 IGLC2P0DOY2 106 aa2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 IGLC3P0DOY3 106 aa2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 IAPPP10997 89 aa2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 NOVP48745 357 aa2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 PIFOQ8TCI5 191 aa2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 KIF1BO60333 1816 aa2.59□□□□□ -1.99
SOCS4-201ENST00000339298 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 PDCD6O75340 191 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 HLA-DRB4P13762 266 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 RIGQ13278 110 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 LINC01620Q4KN68 170 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 CASC2Q6XLA1 102 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 Q6ZS49 121 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 TEN1Q86WV5 123 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 CRYGNQ8WXF5 182 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 TEX37Q96LM6 180 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 RBAKDNA6NC62 111 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 PSPHP1O15172 72 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 IGLV2-14P01704 120 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 CRPP02741 224 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 PSMB8P28062 276 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 FOXE3Q13461 319 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 C22orf39Q6P5X5 142 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa2.59□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 TTC3P53804 2025 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 C1orf105O95561 183 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 CGB2Q6NT52 195 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 APCDD1LQ8NCL9 501 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 VOPP1Q96AW1 172 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 ICOSQ9Y6W8 199 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 PLIN4Q96Q06 1357 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 CEP290O15078 2479 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 PITX3O75364 302 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 IGKV2-30P06310 120 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 GNLYP22749 145 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 GCHFRP30047 84 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 TMEM42Q69YG0 159 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 COQ2Q96H96 371 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 SMIM14Q96QK8 99 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 KLK13Q9UKR3 277 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 URB1O60287 2271 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 PPLO60437 1756 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 A0A087WW49 117 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 TYROBPO43914 113 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 DYNLT3P51808 116 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 ADORA2A-AS1P86434 159 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 C1orf61Q13536 156 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 FAM74A4Q5TZK3 123 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 LINC01545Q5VT33 79 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 GDF15Q99988 308 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 OVOL2Q9BRP0 275 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 FGF22Q9HCT0 170 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 Q9UF83 564 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 LY96Q9Y6Y9 160 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 SOCS1O15524 211 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 KIAA0087Q14695 138 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 C2orf66Q6UXQ4 117 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF563Q8TA94 476 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 SHISA4Q96DD7 197 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 CYTL1Q9NRR1 136 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 SCN5AQ14524 2016 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 TSPOAP1O95153 1857 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 TMEM78Q5T7P6 136 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 C1orf140Q5VVS0 124 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 UBL5Q9BZL1 73 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 WNK2Q9Y3S1 2297 aa2.58□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 IGLC7A0M8Q6 106 aa2.57□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 NDUFAF8A1L188 74 aa2.57□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 M0R135 149 aa2.57□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 PPP1R17O96001 155 aa2.57□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 ATP5G1P05496 136 aa2.57□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 C3orf79P0CE67 100 aa2.57□□□□□ -2
SOCS4-201ENST00000339298 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms