RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 H7C2G1 150 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 POU2AF1Q16633 256 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZSR3 168 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 RCHY1Q96PM5 261 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 K7EMI3 77 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-201ENST00000261266 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF815PA8K554 130 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRB-201ENST00000261266 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRB-201ENST00000261266 A8MWV9 139 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRB-201ENST00000261266 CCDC88CQ9P219 2028 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 M0R2P5 195 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRB-201ENST00000261266 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 ATOH7Q8N100 152 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 Q8N8P6 123 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 FOXE3Q13461 319 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 SFTA2Q6UW10 78 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 RNF152Q8N8N0 203 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-201ENST00000261266 C11orf52Q96A22 123 aa7.31□□□□□ -1.24
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