RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 LYZL4Q96KX0 146 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 MESP1Q9BRJ9 268 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 MYOFQ9NZM1 2061 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 ESDP10768 282 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 TOMM40O96008 361 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 PLNP26678 52 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.16□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 CKAP5Q14008 2032 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 CCL1P22362 96 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 CFHR3Q02985 330 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 Q5BKY6 102 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 F5H768 121 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 MRAPQ8TCY5 172 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 COL8A2P25067 703 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.15□□□□□ -1.26
CYFIP1-208ENST00000617928 E9PQ18 207 aa7.15□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 DPM2O94777 84 aa7.15□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 LHBP01229 141 aa7.15□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.15□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ERCC8Q13216 396 aa7.15□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.15□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 CD5P06127 495 aa7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SYNJ2BPP57105 145 aa7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 PSPNO60542 156 aa7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 GZMBP10144 247 aa7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 C5orf30Q96GV9 206 aa7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 M0R2P5 195 aa7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 UBE2CO00762 179 aa7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 C1orf159Q96HA4 380 aa7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1B0GTI1 187 aa7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 F2Z2F3 143 aa7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SPINK8P0C7L1 97 aa7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00271P0C7V0 271 aa7.14□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 DAD1P61803 113 aa7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 UBE2V1Q13404 147 aa7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 C18orf12Q96KH6 178 aa7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SS18Q15532 418 aa7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKCP01834 107 aa7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 M0R1W7 72 aa7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 PSG1P11464 419 aa7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SPTBP11277 2137 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SAA4P35542 130 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR31Q5SQ13 230 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 USMG5Q96IX5 58 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 C1QTNF9P0C862 333 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ADMP35318 185 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 CCL20P78556 96 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 FOXL1Q12952 345 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 LAGE3Q14657 143 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ANKRD36A6QL64 1941 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 NCR2O95944 276 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 EFNB3Q15768 340 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 ATP6V0BQ99437 205 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM223BA6NKX1 122 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 MSMBP08118 114 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 DEFB131AP59861 70 aa7.12□□□□□ -1.27
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms