RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 OR4A5Q8NH83 315 aa10.32□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 TMEM167BQ9NRX6 74 aa10.32□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa10.31□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 C8orf88P0DMB2 117 aa10.31□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 MC5RP33032 325 aa10.31□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 TNXAQ16473 311 aa10.31□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 TMEM183BQ1AE95 376 aa10.31□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
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PRAME-213ENST00000492657 SLC25A2Q9BXI2 301 aa10.31□□□□□ -0.76
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PRAME-213ENST00000492657 IGLV1-47P01700 117 aa10.31□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 PPIAL4GP0DN37 164 aa10.31□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 ADORA2A-AS1P86434 159 aa10.31□□□□□ -0.76
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PRAME-213ENST00000492657 MMD2Q8IY49 270 aa10.31□□□□□ -0.76
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PRAME-213ENST00000492657 INS-IGF2F8WCM5 200 aa10.3□□□□□ -0.76
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PRAME-213ENST00000492657 LCN12Q6JVE5 192 aa10.3□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 LINC00479Q96M42 142 aa10.3□□□□□ -0.76
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PRAME-213ENST00000492657 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa10.3□□□□□ -0.76
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PRAME-213ENST00000492657 TAS2R45P59539 299 aa10.29□□□□□ -0.76
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PRAME-213ENST00000492657 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.762e-36■■□□□ 13
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PRAME-213ENST00000492657 C10orf113Q5VZT2 155 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 TEX45Q8NA69 505 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.28□□□□□ -0.76
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PRAME-213ENST00000492657 ORM2P19652 201 aa10.28□□□□□ -0.76
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PRAME-213ENST00000492657 ZFP30Q9Y2G7 519 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-213ENST00000492657 COL12A1Q99715 3063 aa10.27□□□□□ -0.76
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PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PRM7 423 aa10.27□□□□□ -0.77
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PRAME-213ENST00000492657 TIGITQ495A1 244 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 THAP8Q8NA92 274 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 SERTAD4Q9NUC0 356 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 NAT8BQ9UHF3 227 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 C20orf202A1L168 122 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 IGLV2-8P01709 118 aa10.27□□□□□ -0.77
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