RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 ARL6IP1Q15041 203 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 CDK10Q15131 360 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q6ZRG5 221 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 LFNGQ8NES3 379 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR4X2Q8NGF9 303 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 S100ZQ8WXG8 99 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ISOC1Q96CN7 298 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RNF5Q99942 180 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 GINS4Q9BRT9 223 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q9HAA7 133 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 PARP11Q9NR21 331 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF221Q9UK13 617 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TENM3Q9P273 2699 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 K7EIL1 84 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 S1PR2O95136 353 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGKV1-39P01597 117 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRBV12-3P01733 135 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 APOA2P02652 100 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 CD74P04233 296 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGKV1D-39P04432 117 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 CTXN2P0C2S0 81 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 APELAP0DMC3 54 aa3.11□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 HLA-DMAP28067 261 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRSS3P35030 304 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RCVRNP35243 200 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 HRH1P35367 487 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAB9AP51151 201 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RORCP51449 518 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMBIM6P55061 237 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 FXYD4P59646 89 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAB4BP61018 213 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 UBE2KP61086 200 aa3.11□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF846Q147U1 533 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 MSMO1Q15800 293 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 KLK9Q2XQG4 91 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF562Q6V9R5 426 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF767PQ75MW2 155 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 KCTD9Q7L273 389 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM17Q86X19 198 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SNX29P2Q8IUI4 249 aa3.11□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ARPC1AQ92747 370 aa3.11□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 OR4F4Q96R69 305 aa3.11□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 EHFQ9NZC4 300 aa3.11□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 V9GYH0 126 aa3.11□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A0G2JRQ6 117 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC00862A6NCI5 91 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 F8W036 122 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 L7N2F9 121 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SULT1C2O00338 296 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 CD3DP04234 171 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RLN1P04808 185 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 VDAC1P21796 283 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 MYCNOSP40205 109 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 LGALS7P47929 136 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC35B1P78383 322 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RUNX1Q01196 453 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 FXYD3Q14802 87 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TNXAQ16473 311 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 POU2AF1Q16633 256 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRSS8Q16651 343 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 COMMD1Q8N668 190 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR5T1Q8NG75 326 aa3.1□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR51H1Q8NH63 302 aa3.1□□□□□ -1.91
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