RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379388.6

HIVEP1-201, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene HIVEP1, Length 9,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-201ENST00000379388 XCL2Q9UBD3 114 aa9.62□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 RCHY1Q96PM5 261 aa9.62□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.62□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 TAS2R60P59551 318 aa9.62□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 PRELID3AQ96N28 172 aa9.62□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 GGACTQ9BVM4 153 aa9.62□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.62□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.62□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 SHISA9B4DS77 424 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 LINC00477Q96M19 166 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 TMEM42Q69YG0 159 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 LEPROTL1O95214 131 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 OR11H1Q8NG94 326 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 CEP250Q9BV73 2442 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 MMP23AO75900 390 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 CRPP02741 224 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 EFNB1P98172 346 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 WFDC1Q9HC57 220 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 A0A0U1RRA0 63 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 H7C1H1 209 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 PSCAO43653 123 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 LRTM2Q8N967 370 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 PI4KAP42356 2102 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 PAX1P15863 534 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 ERCC8Q13216 396 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 COL4A3Q01955 1670 aa9.61□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 VENTXO95231 258 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 TMEM50AO95807 157 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 FHL1Q13642 323 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 PRO3102Q9H379 93 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 OR1P1Q8NH06 330 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 LIME1Q9H400 295 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 EPDR1Q9UM22 224 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 LINC01619G3V211 115 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 IGKV1-5P01602 117 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 EFNB3Q15768 340 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 RNF126Q9BV68 326 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 NDUFB8O95169 186 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 FMC1Q96HJ9 113 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa9.6□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 OOSP1A8MZH6 123 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 HBBP68871 147 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 KNCNA6PVL3 124 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 A0A1B0GWJ7 208 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 SNAI2O43623 268 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 DEFB136Q30KP8 78 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 DNLZQ5SXM8 178 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 TMEM249Q2WGJ8 235 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 H0YIZ8 118 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 KCNS1Q96KK3 526 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 STPG2Q8N412 459 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 A0A0G2JRQ6 117 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 VOPP1Q96AW1 172 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 SCN8AQ9UQD0 1980 aa9.59□□□□□ -0.87
HIVEP1-201ENST00000379388 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 CFAP161Q6P656 301 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 NDUFA3O95167 84 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 GATA3P23771 443 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 TREML4Q6UXN2 200 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 VPS25Q9BRG1 176 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 RNF182Q8N6D2 247 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 RNF222A6NCQ9 220 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 BTCP35070 178 aa9.58□□□□□ -0.88
HIVEP1-201ENST00000379388 NAPSAO96009 420 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms