RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr275Q7TS18 319 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cavin3Q91VJ2 260 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrpl18Q9CQL5 180 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 StrapQ9Z1Z2 350 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm6665F6Y363 85 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr143P34985 313 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kcnj3P63250 501 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lclat1Q3UN02 376 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Coq2Q66JT7 374 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gal3st2Q6XQH0 394 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1330Q8VEY6 315 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fgfrl1Q91V87 529 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf126Q91YL2 313 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CenpmQ9CQA0 180 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc50a1Q9CXK4 221 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnase6Q9D244 153 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fbxl17Q9QZN1 701 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fhl3Q9R059 289 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SetxA2AKX3 2646 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv5-2A0A0A6YVX8 117 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm35060A0A140LIV7 231 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10638F6QEG2 257 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PomcP01193 235 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gabra2P26048 451 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ube2kP61087 200 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ldlrad2Q3V0V0 142 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 EpopQ7TNS8 369 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r237Q8R296 289 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PigcQ9CXR4 297 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pcnx2Q5DU28 2122 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21778A0A087WNP8 232 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr753-ps1A0A140LHN3 164 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm4884E9PVP9 694 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Folr2Q05685 251 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stoml3Q6PE84 287 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rsl1Q7M6Y1 485 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 LgalslbQ7TPX9 165 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Poc1aQ8JZX3 405 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1448Q8VFX1 314 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4930412O13RikQ9D5M9 106 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrpl30Q9D7N6 160 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nek7Q9ES74 302 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem9bQ9JJR8 199 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r160E9Q346 307 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r123L7N270 307 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RorcP51450 516 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trdv4Q5R1A3 115 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr874Q7TRE6 310 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trib1Q8K4K4 372 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znrf1Q91V17 227 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4933400A11RikQ9CR52 288 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SelenofQ9ERR7 162 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hsf4Q9R0L1 492 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfhx3Q61329 3726 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav5-1A0A075B5Z7 114 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav5-4A0A075B652 114 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rbm24D3Z4I3 236 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm2381G3UY53 305 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MyadmO35682 320 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rps16P14131 146 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ElobP62869 118 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lyplal1Q3UFF7 239 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AgerQ62151 402 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TprkbQ8QZZ7 175 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rpp21Q8R040 150 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr470Q8VF65 314 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ndufa6Q9CQZ5 131 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Xrcc3Q9CXE6 349 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hint2Q9D0S9 163 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q9DAF8 208 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Smco4Q9JIS3 59 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 H60bB1B212 251 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm4744D3Z3S5 154 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 H3f3cP02301 136 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cpne2P59108 548 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav6-2Q5R1I4 113 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vdac1Q60932 296 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Usf1Q61069 310 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Psg16Q8K0U8 395 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr362Q8VGV7 317 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PifoQ9D9W1 207 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 St6galnac6Q9JM95 333 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Usf3B2RUQ2 2221 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv1-67A0A0G2JFN9 117 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm14548E9Q1Z6 680 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pwwp2bE9Q9M8 600 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Clec3bP43025 202 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SspnQ62147 216 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Il22ra2Q80XF5 230 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r66Q8K4I0 310 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Crybb1Q9WVJ5 250 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PoleQ9WVF7 2283 aa11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnajc13D4AFX7 2248 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Iglv1A0A075B663 117 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm14124A2AU83 715 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adamts17E9Q4D1 1122 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ly6c1P0CW02 131 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hspb7P35385 169 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp936Q3ULA8 456 aa11.32□□□□□ -0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Taar3Q5QD16 343 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 97 ms