Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES74

Nek7, Serine/threonine-protein kinase Nek7, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek7Q9ES74 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Nek7Q9ES74 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek7Q9ES74 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek7Q9ES74 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek7Q9ES74 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Nek7Q9ES74 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nek7Q9ES74 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nek7Q9ES74 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek7Q9ES74 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek7Q9ES74 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nek7Q9ES74 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek7Q9ES74 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek7Q9ES74 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek7Q9ES74 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek7Q9ES74 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek7Q9ES74 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek7Q9ES74 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek7Q9ES74 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek7Q9ES74 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek7Q9ES74 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek7Q9ES74 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek7Q9ES74 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek7Q9ES74 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek7Q9ES74 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek7Q9ES74 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek7Q9ES74 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek7Q9ES74 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek7Q9ES74 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek7Q9ES74 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek7Q9ES74 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek7Q9ES74 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek7Q9ES74 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek7Q9ES74 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek7Q9ES74 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nek7Q9ES74 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek7Q9ES74 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek7Q9ES74 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek7Q9ES74 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek7Q9ES74 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek7Q9ES74 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek7Q9ES74 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek7Q9ES74 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek7Q9ES74 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek7Q9ES74 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek7Q9ES74 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek7Q9ES74 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek7Q9ES74 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek7Q9ES74 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek7Q9ES74 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek7Q9ES74 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek7Q9ES74 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek7Q9ES74 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek7Q9ES74 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nek7Q9ES74 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nek7Q9ES74 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nek7Q9ES74 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek7Q9ES74 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek7Q9ES74 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek7Q9ES74 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nek7Q9ES74 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek7Q9ES74 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek7Q9ES74 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek7Q9ES74 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek7Q9ES74 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek7Q9ES74 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek7Q9ES74 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek7Q9ES74 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek7Q9ES74 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek7Q9ES74 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek7Q9ES74 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek7Q9ES74 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek7Q9ES74 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek7Q9ES74 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek7Q9ES74 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek7Q9ES74 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek7Q9ES74 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek7Q9ES74 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek7Q9ES74 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek7Q9ES74 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek7Q9ES74 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek7Q9ES74 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek7Q9ES74 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nek7Q9ES74 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek7Q9ES74 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek7Q9ES74 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek7Q9ES74 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek7Q9ES74 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek7Q9ES74 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek7Q9ES74 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek7Q9ES74 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek7Q9ES74 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek7Q9ES74 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek7Q9ES74 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek7Q9ES74 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek7Q9ES74 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek7Q9ES74 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek7Q9ES74 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek7Q9ES74 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek7Q9ES74 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek7Q9ES74 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms