RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	DEFA4	P12838	97 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	TNFRSF1A	P19438	455 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	TNXA	Q16473	311 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	PSG3	Q16557	428 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	LINC01560	Q8TB33	94 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	CACNA1A	O00555	2505 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659		E7EQL1	145 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	RELB	Q01201	579 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	RAB31	Q13636	194 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	TREML4	Q6UXN2	200 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	ATRX	P46100	2492 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	EDDM3A	Q14507	147 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	MUC21	Q5SSG8	566 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	FAM201A	Q5SY85	155 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BBS1-225	ENST00000630659	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	OR5AL1	P0C617	328 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	S100A7	P31151	101 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	CCL8	P80075	99 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	NEUROG1	Q92886	237 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	RRH	O14718	337 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	OR52E5	Q8NH55	327 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	AP1S3	Q96PC3	154 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	MGST2	Q99735	147 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	ZZEF1	O43149	2961 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	SPINT2	O43291	252 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	SSTR5	P35346	364 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	PLA2G5	P39877	138 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	CDSN	Q15517	529 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	C15orf65	H3BRN8	121 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	SLA	Q13239	276 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	EFNB3	Q15768	340 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	DYSF	O75923	2080 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	CACNA1D	Q01668	2161 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1B0GV72	72 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	FNDC10	F2Z333	226 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	PPOX	P50336	477 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	CR1L	Q2VPA4	569 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	MIC13	Q5XKP0	118 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	GAFA1	Q96PS6	74 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	SMPX	Q9UHP9	88 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	C7orf71	A4D174	169 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659		A6NDN8	102 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659		B9A039	149 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	PLAU	P00749	431 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	RIPPLY3	P57055	190 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	RFESD	Q8TAC1	157 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659		H3BRM9	83 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	SPINK4	O60575	86 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	GPR183	P32249	361 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM186	Q96B77	213 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	CCL13	Q99616	98 aa		12.42	□□□□□ -0.42
BBS1-225	ENST00000630659	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		12.42	□□□□□ -0.42

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