RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 CACNA1BQ00975 2339 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 DSCAMO60469 2012 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SCN9AQ15858 1988 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 DPRXA6NFQ7 191 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CLDN25C9JDP6 229 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 E7EQ34 232 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 M0QZK8 103 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SLC25A20O43772 301 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 MED6O75586 246 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 IFNA7P01567 189 aa3.05□□□□□ -1.92
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STRADB-210ENST00000498648 SERPINB10P48595 397 aa3.05□□□□□ -1.92
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STRADB-210ENST00000498648 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ZNF616Q08AN1 781 aa3.05□□□□□ -1.92
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STRADB-210ENST00000498648 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ZNF709Q8N972 641 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 LXNQ9BS40 222 aa3.05□□□□□ -1.92
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STRADB-210ENST00000498648 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SIPA1L1O43166 1804 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 FOCADQ5VW36 1801 aa3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SSC5DA1L4H1 1573 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 REV3LO60673 3130 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 XIRP2A4UGR9 3374 aa3.04□□□□□ -1.92
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STRADB-210ENST00000498648 A0A087X0T9 212 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 I3L521 148 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 IGLV7-43P04211 117 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CCL3P10147 92 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 PSMD8P48556 350 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 RAB13P51153 203 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 RWDD2BP57060 319 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 PSPHP78330 225 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CCL20P78556 96 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SPINK14Q6IE38 97 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SSX8Q7RTT4 187 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 OR13C4Q8NGS5 318 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 OR5J2Q8NH18 312 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 FNDC9Q8TBE3 224 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ZNF675Q8TD23 568 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CAPZA3Q96KX2 299 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 C2orf50Q96LR7 162 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 GSKIPQ9P0R6 139 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SNX12Q9UMY4 172 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ATRXP46100 2492 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa3.04□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 A0A0B4J2C4 111 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 RIIAD1A6NNX1 92 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 UBE2L6O14933 153 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 PIAS1O75925 651 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 NDUFB2O95178 105 aa3.03□□□□□ -1.92
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STRADB-210ENST00000498648 GABRA2P47869 451 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 PIGPP57054 158 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 DHRS2Q13268 280 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 LTC4SQ16873 150 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 RASL11AQ6T310 242 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 RPRMLQ8N4K4 120 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 MMGT1Q8N4V1 131 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TCEAL4Q96EI5 215 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CCDC32Q9BV29 185 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 JPT1Q9UK76 154 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ZNF835Q9Y2P0 537 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CHD9Q3L8U1 2897 aa3.03□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa3.02□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 C5orf42Q9H799 3197 aa3.02□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 TRANK1O15050 2925 aa3.02□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.02□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 IGKV1-5P01602 117 aa3.02□□□□□ -1.93
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STRADB-210ENST00000498648 IL4P05112 153 aa3.02□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 SLC25A16P16260 332 aa3.02□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 HIST1H2BOP23527 126 aa3.02□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 CRABP2P29373 138 aa3.02□□□□□ -1.93
STRADB-210ENST00000498648 S100A7P31151 101 aa3.02□□□□□ -1.93
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