RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 MLNRO43193 412 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 FOLR2P14207 255 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 MYOD1P15172 320 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 CHD8Q9HCK8 2581 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 PYYP10082 97 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 TAS2R60P59551 318 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 WNT2P09544 360 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 HGFACQ04756 655 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 OR4D5Q8NGN0 318 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM70Q9BUB7 260 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 PRR14LQ5THK1 2151 aa11.02□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 BPTFQ12830 3046 aa11.02□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa11.02□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa11.02□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM219Q86XT9 240 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 C20orf204Q6ZNR8 217 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 NEUROG1Q92886 237 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 IL36BQ9NZH7 164 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 HTTP42858 3142 aa11.02□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 CIDEAO60543 219 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 REC114Q7Z4M0 266 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 RPRMLQ8N4K4 120 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 C8orf46Q8TAG6 207 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 PSMB11A5LHX3 300 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 COLCA2A8K830 154 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 SDF2L1Q9HCN8 221 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF581Q9P0T4 197 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 B4DSR2 109 aa11.01□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 PRSS8Q16651 343 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 BRD3OSQ6XYD6 125 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 KIR3DL3Q8N743 410 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 GLMPQ8WWB7 406 aa11.01□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 IMMP2LQ96T52 175 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.01□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 VMO1Q7Z5L0 202 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 DMRT1Q9Y5R6 373 aa11□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 C18orf15Q96N68 181 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 DUX3Q96PT4 197 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PRE2 83 aa11□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 UBE2CO00762 179 aa11□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 GNG5P63218 68 aa11□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 PLA2G2CQ5R387 149 aa11□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa11□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa10.99□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 H3BUX3 64 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 H7C1H1 209 aa10.99□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 DSCR9P59020 149 aa10.99□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 SPATA45Q537H7 98 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 VOPP1Q96AW1 172 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 WISP1O95388 367 aa10.99□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 TREML4Q6UXN2 200 aa10.99□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 LINC01587Q99440 93 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 ATG101Q9BSB4 218 aa10.99□□□□□ -0.65
HDLBP-241ENST00000487169 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.99□□□□□ -0.65
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HDLBP-241ENST00000487169 HELZP42694 1942 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
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