RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 CYB5BO43169 146 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 GNG7O60262 68 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 CLN5O75503 358 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4E1P0C645 316 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 IAPPP10997 89 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 OPRK1P41145 380 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 HTR2BP41595 481 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 ODF1Q14990 250 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIQKQ629K1 86 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 DUSP18Q8NEJ0 188 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4X1Q8NH49 305 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 DEDD2Q8WXF8 326 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 ST8SIA2Q92186 375 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 PALMDQ9NP74 551 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 ENY2Q9NPA8 101 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 U3KQK5 164 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 CCNKO75909 580 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 YIF1AO95070 293 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLC1P0CG04 106 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 NPY1RP25929 384 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 NPBWR1P48145 328 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 RND2P52198 227 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 DHRS2Q13268 280 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 LYG2Q86SG7 212 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM24BQ8N5W8 94 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 STPG3Q8N7X2 389 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4D5Q8NGN0 318 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1S1Q8NH92 325 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 DTD1Q8TEA8 209 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 NPIPB3Q92617 1050 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 MARC2Q969Z3 335 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 RCHY1Q96PM5 261 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC22CQ9BRL7 303 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 VSIRQ9H7M9 311 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 SRD5A3Q9H8P0 318 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS46E5RG02 174 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 WRBO00258 174 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN4O14817 238 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 LYRM1O43325 122 aa5.2□□□□□ -1.58
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RABGEF1-206ENST00000461017 TCRBP04435 133 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A6P12236 298 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 ANXA3P12429 323 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 TFPI2P48307 235 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 INPP1P49441 399 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 PAX9P55771 341 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
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RABGEF1-206ENST00000461017 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.2□□□□□ -1.58
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RABGEF1-206ENST00000461017 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM110AQ9BQ89 295 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBA4BQ9H853 241 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 U3KQE9 123 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BP45 60 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 CORTO00230 105 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 CCSO14618 274 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 CRYBB3P26998 211 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10J1P30954 320 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 SRPXP78539 464 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1-206ENST00000461017 ID3Q02535 119 aa5.19□□□□□ -1.58
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