RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 DAD1P61803 113 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 F5H768 121 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 CR1LQ2VPA4 569 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 SRRM5B3KS81 715 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 LHBP01229 141 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 HBDP02042 147 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 EPDR1Q9UM22 224 aa8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 FAM223BA6NKX1 122 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 FCN3O75636 299 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF250P15622 560 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 F2Z2F3 143 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 PAX4O43316 350 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 C1QTNF9P0C862 333 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF876PQ49A33 203 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 PPBPP02775 128 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 HIGD1CA8MV81 97 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.72□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 COL4A5P29400 1685 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 LINC01549A6NIU2 74 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 A6NNC1 897 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 ATP5G3P48201 142 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 SYNJ2BPP57105 145 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 SS18Q15532 418 aa8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
TRPS1-201ENST00000220888 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 APOC4P55056 127 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 ABCA1O95477 2261 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 DPRXA6NFQ7 191 aa8.71□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 PYYP10082 97 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 SAA4P35542 130 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 RMI2Q96E14 147 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 SEC11AP67812 179 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1B0GTI1 187 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 PSG1P11464 419 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 CRYGSP22914 178 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 NDPQ00604 133 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 UBR3Q6ZT12 1888 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 ERCC8Q13216 396 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1B0GWB2 263 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 LINC01619G3V211 115 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 TOMM40O96008 361 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 TYMSP04818 313 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 COL8A2P25067 703 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 RASL10AQ92737 203 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 LY6HO94772 140 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 GZMBP10144 247 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 SELLP14151 372 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 C1orf159Q96HA4 380 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1B0GWJ7 208 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 GATD1Q8NB37 220 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 COQ2Q96H96 371 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 DEFB131AP59861 70 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 MDS2Q8NDY4 140 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 NMBP08949 121 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00614P0C842 121 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00477Q96M19 166 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 SNAI2O43623 268 aa8.68□□□□□ -1.02
TRPS1-201ENST00000220888 RAMP3O60896 148 aa8.68□□□□□ -1.02
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