RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032487.13

Vamp1-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp1, Length 2,772 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dnase2bQ9QY48 354 aa9.96□□□□□ -0.81
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ndufa7Q9Z1P6 113 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trav6d-5A0A075B6B9 112 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm43191F6YIH5 235 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 H3BKT1 185 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Scd2P13011 358 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CebpgP53568 150 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr32Q7TQZ0 308 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Phf13Q8K2W6 296 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr983Q8VG90 315 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr206Q8VGP9 306 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ddit4lQ8VHZ5 193 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mpped1Q91ZG2 326 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Chrdl1Q920C1 447 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Susd2Q9DBX3 820 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem25Q9DCF1 365 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr930Q9EQ99 308 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 VcanQ62059 3357 aa9.96□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trbv1A0A0B4J1G7 116 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp708F8VPP0 541 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hnrnpa2b1O88569 353 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lef1P27782 397 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vipr2P41588 437 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 RidaP52760 135 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp954Q7TNU5 416 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp747Q8BHM7 422 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cops7aQ9CZ04 275 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ldb3Q9JKS4 723 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Spry4Q9WTP2 300 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cacna1gQ5SUF7 2381 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 A0A1Y7VIT9 351 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pglyrp3A1A547 347 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nat8f4G5E8L3 226 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm21783J3QM57 227 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rab33bO35963 229 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ccl22O88430 92 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 P01808 119 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 GzmaP11032 260 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hsd17b8P50171 259 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lhx4P53776 390 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm7534Q3UU21 679 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Psmb6Q60692 238 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr147Q60886 317 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Iglon5Q8HW98 336 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr510Q8VEW6 314 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp958Q99LG7 467 aa9.95□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 2010106E10RikA2ANY3 279 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr196E9PYP4 309 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ifitm7G3X9Z2 141 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pde6dO55057 150 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mdga2P60755 949 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cln5Q3UMW8 341 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp85Q7TMC9 473 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ifna14Q810G3 189 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Znf574Q8BY46 900 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Depp1Q8K2F3 205 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr350Q8VFP8 312 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 MrgprgQ91ZB5 289 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem70Q921N7 253 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Abhd14aQ922Q6 247 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mrpl24Q9CQ06 216 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Chst1Q9EQC0 411 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Igkv17-127A0A0G2JDN5 117 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ear14F6YUX7 155 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rnase2O35291 155 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 P01649 108 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Id3P41133 119 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pom121l2Q5SW25 972 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 YbeyQ8CAV0 164 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr351Q8VGK1 310 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nkg7Q99PA5 165 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn1r172Q9EPS4 313 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cbln1Q9R171 193 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fzr1Q9R1K5 493 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem196V9GX04 182 aa9.94□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm13030A2APQ6 143 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Esp6A8R0U0 136 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc18b1D3Z5L6 459 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fam240bJ3QMB3 78 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Amy2P00688 508 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Csn2P10598 231 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cr2P19070 1025 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mas1P30554 324 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc25a33Q3TZX3 320 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trat1Q3UU67 187 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Psg27Q497W2 474 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm20816Q5FWD4 227 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PtafrQ62035 341 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Bst1Q64277 311 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Acp7Q8BX37 438 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mob1aQ921Y0 216 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tctex1d2Q9CQ66 144 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Aig1Q9D8B1 262 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Klf5Q9Z0Z7 446 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 B4galt2Q9Z2Y2 369 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Colca2F8VPY8 239 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Arf6P62331 175 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tas2r107Q7M725 308 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr107Q7TRK4 309 aa9.93□□□□□ -0.82
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ifna13Q80SU4 189 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.4 ms