RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 YEATS4O95619 227 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 PPYP01298 95 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 COX6A1P12074 109 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 F8A1P23610 371 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 CSN1S1P47710 185 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 CAV3P56539 151 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 FXYD4P59646 89 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 SNAP25P60880 206 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 KLK9Q2XQG4 91 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC184Q52MB2 194 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 GLT8D1Q68CQ7 371 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 HBMQ6B0K9 141 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 Q8N402 240 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR4E2Q8NGC2 313 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2T27Q8NH04 317 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2AE1Q8NHA4 323 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 Q8WTZ3 238 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAB2BQ8WUD1 216 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 MCUR1Q96AQ8 359 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 TLCD1Q96CP7 247 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 Q96NJ1 140 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 METTL9Q9H1A3 318 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 CXorf21Q9HAI6 301 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 LYRM4Q9HD34 91 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 TAS2R13Q9NYV9 303 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 IFNKQ9P0W0 207 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 SBF1O95248 1867 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 HECW2Q9P2P5 1572 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 F5H768 121 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 LYNX1G3V0Z9 82 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 COPEO14579 308 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 CXCL11O14625 94 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 ENSAO43768 121 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 HBZP02008 142 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM228BP0C875 321 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 TUBG1P23258 451 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 LCN2P80188 198 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 WFDC2Q14508 124 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 RHEBQ15382 184 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 SYPL2Q5VXT5 272 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 ASCL4Q6XD76 172 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 PID1Q7Z2X4 250 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 MICU2Q8IYU8 434 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM45AQ8TCE6 357 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAB1BQ9H0U4 201 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 TANC1Q9C0D5 1861 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 TOPBP1Q92547 1522 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPAG17Q6Q759 2223 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZGRF1Q86YA3 2104 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A0D9SG52 128 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 K7EN84 100 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2B3O76000 313 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 MBP02144 154 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 FGF6P10767 208 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 CASP1P29466 404 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 KCNJ3P48549 501 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAB13P51153 203 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 DAD1P61803 113 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 C1DQ13901 141 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRAM1Q15629 374 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPANXN2Q5MJ10 180 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 GLYATL3Q5SZD4 288 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARMC12Q5T9G4 340 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 ULK3Q6PHR2 472 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 TEN1Q86WV5 123 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRRC6Q86X45 466 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 PFN4Q8NHR9 129 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM254Q8TBM7 123 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 TEX47Q8TBZ9 253 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 FKBP14Q9NWM8 211 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRELID1Q9Y255 219 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-287P-201ENST00000516230 ALKQ9UM73 1620 aa-1.22□□□□□ -2.61
RNU6-287P-201ENST00000516230 SOGA1O94964 1423 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-287P-201ENST00000516230 ERBINQ96RT1 1412 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARHGEF11O15085 1522 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRAV3A0A0B4J244 114 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-287P-201ENST00000516230 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-287P-201ENST00000516230 GOLGA8OA6NCC3 632 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-287P-201ENST00000516230 FABP5P3A8MUU1 101 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-287P-201ENST00000516230 EFCAB9A8MZ26 197 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-287P-201ENST00000516230 F8W1H4 67 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-287P-201ENST00000516230 GOLGA8NF8WBI6 632 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-287P-201ENST00000516230 GOLGA8TH3BQL2 631 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-287P-201ENST00000516230 COX7A2LO14548 114 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPR171O14626 319 aa-1.23□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms