RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A1O15245 554 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 PPBPP02775 128 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP12-4P60329 112 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 CCL7P80098 99 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 EDDM3AQ14507 147 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM86AQ8N2M4 240 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRBP23467 1997 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 COL24A1Q17RW2 1714 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 DOCK10Q96BY6 2186 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 GBF1Q92538 1859 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 SAMD9Q5K651 1589 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 TTRP02766 147 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 RPL5P46777 297 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 AP3S2P59780 193 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 MCFD2Q8NI22 146 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 NUP155O75694 1391 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 NRAPQ86VF7 1730 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 FMN2Q9NZ56 1722 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP5Q13017 1502 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 GREB1Q4ZG55 1949 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 LAMC1P11047 1609 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 GPX1P07203 203 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2BOP23527 126 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2BBP33778 126 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 EVX1P49640 407 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2BDP58876 126 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2BCP62807 126 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 SPA17Q15506 151 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 BORCS7Q96B45 105 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 FBXL12Q9NXK8 326 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRC-212ENST00000491302 MTUS2Q5JR59 1369 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM2Q9UHN6 1383 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 LMTK2Q8IWU2 1503 aa3.09□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 PLXNC1O60486 1568 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0D9SEW6 157 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF860A6NHJ4 632 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM210A6NLX4 147 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 SIGLEC16A6NMB1 481 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 NAPSAO96009 420 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 HBA1P69905 142 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 KCNJ8Q15842 424 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 SYCP2Q9BX26 1530 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 OR4C46A6NHA9 309 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 FAAHO00519 579 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 C1QCP02747 245 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFA5Q16718 116 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 OR13C4Q8NGS5 318 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 ITFG2Q969R8 447 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 DERL1Q9BUN8 251 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM4Q9C037 500 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf167Q5SNV9 1468 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 NALCNQ8IZF0 1738 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 CHD8Q9HCK8 2581 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 OR51F1A6NGY5 319 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 CRYZL1O95825 349 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 CTXN2P0C2S0 81 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 DEFA4P12838 97 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 MUC3AQ02505 3323 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 FAM27BQ5VT28 67 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 SBF2Q86WG5 1849 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 OR5B17Q8NGF7 314 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 CHMP6Q96FZ7 201 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN32Q96QS1 320 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 GLTPQ9NZD2 209 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 DOK5Q9P104 306 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 MAST2Q6P0Q8 1798 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 FYCO1Q9BQS8 1478 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WUJ7 227 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-212ENST00000491302 FXYD2P54710 66 aa3.05□□□□□ -1.92
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