RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433972.1

RPUSD3-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, human

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 1,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD3-208	ENST00000433972	MLX	Q9UH92	298 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972		A0A0G2JRQ6	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972		A0A1B0GU03	582 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	C8orf88	P0DMB2	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	GPR183	P32249	361 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	APOC4	P55056	127 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	PPP1R1A	Q13522	171 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	SMCO1	Q147U7	214 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	C4orf46	Q504U0	113 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972		Q6ZRM9	215 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	NOXA1	Q86UR1	476 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	LRTM2	Q8N967	370 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	COQ8A	Q8NI60	647 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972		S4R3C0	116 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPUSD3-208	ENST00000433972	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	CORT	O00230	105 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	PLA2G10	O15496	165 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	EDN2	P20800	178 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	AARD	Q4LEZ3	155 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	TM4SF20	Q53R12	229 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	SPINK9	Q5DT21	86 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	ZNF114	Q8NC26	417 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	OR1S1	Q8NH92	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	MISP3	Q96FF7	219 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	PRR13	Q9NZ81	148 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	C9orf170	A2RU37	121 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	UBE2C	O00762	179 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	TGOLN2	O43493	480 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	IFNA21	P01568	189 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	OR4E1	P0C645	316 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	HTR2B	P41595	481 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	UPK1B	O75841	260 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	TCRB	P04435	133 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	SLC25A6	P12236	298 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	MFAP4	P55083	255 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972		Q56UQ5	140 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	NMS	Q5H8A3	153 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972		Q6ZWC4	215 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	LYG2	Q86SG7	212 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	TXN2	Q99757	166 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	NUPR2	A6NF83	97 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	OR4C46	A6NHA9	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	NDUFA4	O00483	81 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	TSPAN4	O14817	238 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	SCGB2A1	O75556	95 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	MED6	O75586	246 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	MT-CO2	P00403	227 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	HOXB5	P09067	269 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	BTC	P35070	178 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	BMI1	P35226	326 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	NPBWR1	P48145	328 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	MFAP2	P55001	183 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	DEFA1	P59665	94 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	DEFA3	P59666	94 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	DHRS2	Q13268	280 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	ASAH1	Q13510	395 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	OR2T8	A6NH00	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	TNFRSF9	Q07011	255 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	ENKUR	Q8TC29	256 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972		U3KQ87	197 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPUSD3-208	ENST00000433972	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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