RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 PRSS2P07478 247 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 TIMP3P35625 211 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 CD69Q07108 199 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 RAX2Q96IS3 184 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 C18orf15Q96N68 181 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 WISP1O95388 367 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM42Q69YG0 159 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 RFNGQ9Y644 331 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 TSPOP30536 169 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 PRCDQ00LT1 54 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 HGFACQ04756 655 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF56Q15929 161 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 SPG11Q96JI7 2443 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TIMM23O14925 209 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 AREGP15514 252 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 EFNB3Q15768 340 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TCF23Q7RTU1 214 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TAS2R60P59551 318 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 NOTCH2Q04721 2471 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV1-5P01602 117 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 CD177Q8N6Q3 437 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 GBF1Q92538 1859 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 HIGD1CA8MV81 97 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TUBA4BQ9H853 241 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 HERPUD1Q15011 391 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PRELID3AQ96N28 172 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 NMSQ5H8A3 153 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 GAGE10A6NGK3 116 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PET117Q6UWS5 81 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0G2JLM5 398 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00205P59089 165 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 OCC1Q8TAD7 63 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 KIR2DL4Q99706 377 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PTPRDP23468 1912 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 HIST1H4GQ99525 98 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TREML4Q6UXN2 200 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TEX29Q8N6K0 151 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 APOHP02749 345 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 HOXA5P20719 270 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PLXNA3P51805 1871 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 C14orf144Q96I85 54 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF125Q96EQ8 232 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 THBDP07204 575 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 CEACAM4O75871 244 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 FMC1Q96HJ9 113 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR81Q562E7 1941 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF524Q96C55 264 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 CTAG1AP78358 180 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 DNLZQ5SXM8 178 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 CD5P06127 495 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ACACBO00763 2458 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 MLNRO43193 412 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM160Q9NX00 188 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 NOTCH4Q99466 2003 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 EPDR1Q9UM22 224 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PRE2 83 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 A6NJY4 79 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SNAI2O43623 268 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 SERF1AO75920 110 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 RHOGP84095 191 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6P435 159 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-202ENST00000392011 COQ2Q96H96 371 aa14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms