RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 CORTO00230 105 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 PLA2G10O15496 165 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 C4orf46Q504U0 113 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 Q56UQ5 140 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 PLET1Q6UQ28 207 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 LRTM2Q8N967 370 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 A0A1B0GU03 582 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 C9orf170A2RU37 121 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 OR2T8A6NH00 312 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 TGOLN2O43493 480 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 UPK1BO75841 260 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 OR2C1O95371 312 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 LY86O95711 162 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 MT-CO2P00403 227 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 CLEC3BP05452 202 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 OR4E1P0C645 316 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 TNFRSF9Q07011 255 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 DHRS2Q13268 280 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 LYG2Q86SG7 212 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 OR1S1Q8NH92 325 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 COQ8AQ8NI60 647 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 ATP6V0BQ99437 205 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 NUDT15Q9NV35 164 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 ZNF320A2RRD8 509 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 I3L2K1 104 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 LGALS9O00182 355 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 HOXB5P09067 269 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 OPRK1P41145 380 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 HTR2BP41595 481 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 ASAH1Q13510 395 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 GPHB5Q86YW7 130 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 PRR25Q96S07 402 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-214ENST00000625905 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 C2orf70A6NJV1 201 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 A8MWP6 167 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 F8W735 103 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 K7EIL1 84 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 GNG7O60262 68 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 SCGB2A1O75556 95 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 IFNA21P01568 189 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 IGLV1-51P01701 117 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 IGHV3-48P01763 117 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 TCRBP04435 133 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 CSN3P07498 182 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 SLC25A6P12236 298 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 SPNP16150 400 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 NPY1RP25929 384 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 MFAP4P55083 255 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 BSXQ3C1V8 233 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 LCN12Q6JVE5 192 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 ENKURQ8TC29 256 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 DTD1Q8TEA8 209 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 TXN2Q99757 166 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 RBKSQ9H477 322 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 PALMDQ9NP74 551 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.02□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 TMEM213A2RRL7 107 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 PITX3O75364 302 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 MED6O75586 246 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 ADAP1O75689 374 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 IFNA10P01566 189 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-214ENST00000625905 GP9P14770 177 aa7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms