RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM50BP56557 158 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 P2RY14Q15391 338 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 RNF141Q8WVD5 230 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 RAB3CQ96E17 227 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM140Q9NV12 185 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 AP4S1Q9Y587 144 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 A0A075B6Q4 140 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 TNFSF12O43508 249 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 HPRT1P00492 218 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 LALBAP00709 142 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 HLA-DQB1P01920 261 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 CTXN2P0C2S0 81 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 HLA-DRB4P13762 266 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 QRFPP83859 136 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 CATR1Q13166 79 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 OR1P1Q8NH06 330 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 UHRF2Q96PU4 802 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 UPK3BQ9BT76 320 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 M0QYG6 137 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 SNAPC5O75971 98 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 MT-CO2P00403 227 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3-48P01763 117 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 CD37P11049 281 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 GABRB1P18505 474 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 NFE4Q86UQ8 179 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 TPRA1Q86W33 373 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 PHYHIPQ92561 330 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.346e-10■■■■□ 20.1
SMAD3-211ENST00000559460 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 RAB11BQ15907 218 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 FCGR1BQ92637 280 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM230Q96A57 120 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.69□□□□□ -1.34
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SMAD3-211ENST00000559460 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 I3L2K1 104 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 EI24O14681 340 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 IGLV2-14P01704 120 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 CRYBB3P26998 211 aa6.68□□□□□ -1.34
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SMAD3-211ENST00000559460 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 ARPC4P59998 168 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 POU2AF1Q16633 256 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 GPHA2Q96T91 129 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 NRN1Q9NPD7 142 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 CBY3A6NI87 242 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 SULT1C2O00338 296 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 SLC17A2O00624 439 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 MYL12BO14950 172 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 ALPLP05186 524 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 CD1AP06126 327 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 P0C879 139 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 OR5I1Q13606 314 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZS49 121 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 CADM3Q8N126 398 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM80Q96HE8 168 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 COMMD9Q9P000 198 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 FAT1Q14517 4588 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1B0GU03 582 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 MARCH11A6NNE9 402 aa6.66□□□□□ -1.34
SMAD3-211ENST00000559460 DTYMKP23919 212 aa6.66□□□□□ -1.34
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