RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527136.1

SIGIRR-208, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 4

Gene SIGIRR, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-208ENST00000527136 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.5□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 K7EPK0 472 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 L7N2F9 121 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 MED6O75586 246 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 OR2J3O76001 311 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 TRGV3P03979 118 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 BCAP31P51572 246 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 TPPP2P59282 170 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 VAMP2P63027 116 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 CFHR3Q02985 330 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 AARDQ4LEZ3 155 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 OR2C3Q8N628 320 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 P2RX4Q99571 388 aa8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 IGHV3-11P01762 117 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 IGHV3-48P01763 117 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 IGHV3-23P01764 117 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 CTRB1P17538 263 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 MFAP2P55001 183 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 RHOGP84095 191 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 TEX38Q6PEX7 206 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 NUDT11Q96G61 164 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 TMEM68Q96MH6 324 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 PSENENQ9NZ42 101 aa8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 A0A1B0GUS0 222 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 SMLR1H3BR10 107 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 NDUFB8O95169 186 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 IGHG4P01861 327 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 CRYGCP07315 174 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 NPY1RP25929 384 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 RAB9AP51151 201 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 C3orf56Q8N813 242 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 OR4C12Q96R67 309 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 NMES1Q9C002 83 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.47□□□□□ -1.05
SIGIRR-208ENST00000527136 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 TMEM50AO95807 157 aa8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 RLN2P04090 185 aa8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 IFNA4P05014 189 aa8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 OR8U8P0C7N1 319 aa8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 HTR2BP41595 481 aa8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 CAV2P51636 162 aa8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 PAX9P55771 341 aa8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ATP5G2Q06055 141 aa8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 IL15RAQ13261 267 aa8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 FOXE3Q13461 319 aa8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 Q5BKY6 102 aa8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ZNF580Q9UK33 172 aa8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 C15orf62A8K5M9 175 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 H0YIZ8 118 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 CYB5BO43169 146 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 CCNKO75909 580 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 MT-CO2P00403 227 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 ELANEP08246 267 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 PSMB8P28062 276 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 PRR31Q5SQ13 230 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 COMMD1Q8N668 190 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 OR1P1Q8NH06 330 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 DUX3Q96PT4 197 aa8.45□□□□□ -1.06
SIGIRR-208ENST00000527136 RAB40CQ96S21 281 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms