RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 F5H5K5 113 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 MS4A18H0YCH9 400 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SLC31A1O15431 190 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 NEURL1O76050 574 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 LEPROTL1O95214 131 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SMIM13P0DJ93 91 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 HLA-DRB4P13762 266 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ARL16Q0P5N6 197 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 PLCXD2Q0VAA5 305 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TNXAQ16473 311 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 MS4A18Q3C1V0 323 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 FIGLAQ6QHK4 219 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 DHRS13Q6UX07 377 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 GAPTQ8N292 157 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 LMX1AQ8TE12 382 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 RTN4RQ9BZR6 473 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A22Q9H936 323 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 FAM60AQ9NP50 221 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 PSG8Q9UQ74 426 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 PIGLQ9Y2B2 252 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 LOXL2Q9Y4K0 774 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.92□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 DNAH14Q0VDD8 3507 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TMEM213A2RRL7 107 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 C17orf100A8MU93 164 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TMEM262E9PQX1 116 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 H3BUT2 72 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 K7ESM1 405 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TNFSF11O14788 317 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 RAB29O14966 203 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SYNGR1O43759 233 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 UTS2O95399 124 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 CLDN1O95832 211 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 NTF3P20783 257 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 CD38P28907 300 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 CDAP32320 146 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 YPEL5P62699 121 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 AESQ08117 197 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TAL2Q16559 108 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TMEM42Q69YG0 159 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 Q6P435 159 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa5.91□□□□□ -1.46
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PKP4-211ENST00000481115 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TEX45Q8NA69 505 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 GJC3Q8NFK1 279 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 OR1F12Q8NHA8 337 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TMEM54Q969K7 222 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 OR2W1Q9Y3N9 320 aa5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 A1L4Q6 167 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 HELTA6NFD8 242 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 C21orf140B9A014 251 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SPRY2O43597 315 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 IGHG1P01857 330 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 IGHG3P01860 377 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 RBM11P57052 281 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 NXPH1P58417 271 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 LPAL2Q16609 132 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 POU2AF1Q16633 256 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 LCN12Q6JVE5 192 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 Q6Q795 121 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ZNF114Q8NC26 417 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 OR10X1Q8NGY0 326 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 OR10D3Q8NH80 312 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 OR1L3Q8NH93 324 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 C16orf52Q8NHV5 167 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 GTSF1Q8WW33 167 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.9□□□□□ -1.46
PKP4-211ENST00000481115 HARBI1Q96MB7 349 aa5.9□□□□□ -1.46
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