RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 IAPPP10997 89 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 TEX38Q6PEX7 206 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 COMMD1Q8N668 190 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 ASCL2Q99929 193 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 MBD2Q9UBB5 411 aa9.67□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 E5RGE8 158 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 AP4M1O00189 453 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 TAS2R30P59541 319 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 WT1-ASQ06250 92 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 SMIM8Q96KF7 97 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 RNF126Q9BV68 326 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 U3KQK5 164 aa9.66□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.65□□□□□ -0.86
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PRAME-208ENST00000438888 APELAP0DMC3 54 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 OR13C7P0DN81 318 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 SLC25A4P12235 298 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 LYL1P12980 280 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 AREGP15514 252 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 PAX9P55771 341 aa9.65□□□□□ -0.86
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PRAME-208ENST00000438888 OR2C3Q8N628 320 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 DCUN1D4Q92564 292 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 PSENENQ9NZ42 101 aa9.65□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRAME-208ENST00000438888 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 H3BP45 60 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 TSC22D2O75157 780 aa9.64□□□□□ -0.87
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PRAME-208ENST00000438888 IGF1P05019 195 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 REG1AP05451 166 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 SNCAP37840 140 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 HTR2BP41595 481 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 P2RY1P47900 373 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 CAV2P51636 162 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 RPP30P78346 268 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
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PRAME-208ENST00000438888 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.64□□□□□ -0.87
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PRAME-208ENST00000438888 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 ZNF580Q9UK33 172 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 U3KQ87 197 aa9.64□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 TRAV41A0A0B4J266 112 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 NPY1RP25929 384 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 FOXE3Q13461 319 aa9.63□□□□□ -0.87
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PRAME-208ENST00000438888 TMEM65Q6PI78 240 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 ZNF546Q86UE3 836 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 ZNF114Q8NC26 417 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 OR4C12Q96R67 309 aa9.63□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 GON7Q9BXV9 100 aa9.63□□□□□ -0.87
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PRAME-208ENST00000438888 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.62□□□□□ -0.87
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PRAME-208ENST00000438888 G3V318 75 aa9.62□□□□□ -0.87
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PRAME-208ENST00000438888 CRYGCP07315 174 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 OR8U8P0C7N1 319 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 CTRB1P17538 263 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 C2orf83Q53S99 150 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 NOXA1Q86UR1 476 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 HYLS1Q96M11 299 aa9.62□□□□□ -0.87
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