RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000105041.9

H2-Q1-202, Transcript of Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene H2-Q1, Length 1,954 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tmprss11fQ8BHM9 439 aa9.87□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Taf15Q8BQ46 557 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Scrt2Q8BTH6 311 aa9.87□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sdhaf2Q8C6I2 164 aa9.87□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Vrk3Q8K3G5 453 aa9.87□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Prodh2Q8VCZ9 456 aa9.87□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cisd1Q91WS0 108 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Naa60Q9DBU2 242 aa9.87□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ergic1Q9DC16 290 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tsc22d4Q9EQN3 387 aa9.87□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Prss22Q9ER10 306 aa9.87□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tpsg1Q9QUL7 311 aa9.87□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ep300B2RWS6 2412 aa9.87□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm11756A2BEJ1 356 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm9047B9EJX3 177 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Vmn2r83E9Q0G7 864 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ear14F6YUX7 155 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm10269G3UWD7 123 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tex45G3XA23 500 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kcnk3O35111 409 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rnase2O35291 155 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Hoxa6P09092 232 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ly6c1P0CW02 131 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 RelP15307 587 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rab3dP35276 219 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ctxn2Q3URE8 81 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm21943Q5FWD5 227 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Prdx2Q61171 198 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ewsr1Q61545 655 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mob1bQ8BPB0 216 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Commd5Q8R395 224 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nfam1Q8R4V1 264 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Olfr1420Q8VF55 309 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Wasf3Q8VHI6 501 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cacng8Q8VHW2 423 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 GhsrQ99P50 364 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Magt1Q9CQY5 335 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Lypd8Q9D7S0 255 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 TslpQ9JIE6 140 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Myo9bQ9QY06 2114 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Hcfc1Q61191 2045 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Olfr1158A2BHP7 313 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Zfp160E9Q459 650 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pwwp2bE9Q9M8 600 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Saa1P05366 122 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ifna7P06799 190 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cxcl1P12850 96 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 AesP63002 197 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Loxl1P97873 607 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fndc4Q3TR08 231 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Spata46Q4FZF2 204 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dlx1Q64317 255 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rsl1Q7M6Y1 485 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Q8BG31 207 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tsen54Q8C2A2 525 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slc16a13Q8CE94 428 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 C1qtnf4Q8R066 326 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pgpep1lQ9CWB5 130 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Olfr943Q9EQ92 314 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fbln5Q9WVH9 448 aa9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Usp24B1AY13 2617 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm21488A0A087WR99 222 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm29049A0A087WSM5 227 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm29866A0A0A6YX04 222 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Lrrc3cA0A1B0GRI5 255 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 B1ARW8 110 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fam98cE9PYD1 344 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm15130F6PYN5 206 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm21118J3QPK8 227 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ndufb11O09111 151 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 P01723 117 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PrkacaP05132 351 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 FblP35550 327 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Hist1h2baP70696 127 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ang4Q3TMQ6 144 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cln6Q3U466 308 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm813Q3UWK9 176 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm10840Q3V2K9 103 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gls2Q571F8 602 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm20909Q5FWB5 227 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm20852Q5M8R5 227 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm20917Q62457 227 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm20809Q62458 227 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm20865Q62460 227 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Olfr358Q7TRY5 330 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm20738Q810R8 227 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Atpaf1Q811I0 324 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cacfd1Q8BG21 171 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dcun1d4Q8CCA0 292 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Olfr1350Q8VF34 308 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Olfr401Q8VFX6 315 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Lmo1Q924W9 156 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mrpl28Q9D1B9 257 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm20806Q9D9T3 227 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dnajc13D4AFX7 2248 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 DscamQ9ERC8 2013 aa9.85□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Trbv29A0A0G2LB96 114 aa9.84□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1700025C18RikA2A580 89 aa9.84□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pm20d2A3KG59 431 aa9.84□□□□□ -0.83
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sdc1P18828 311 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54 ms