Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Mrpl28Q9D1B9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mrpl28Q9D1B9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mrpl28Q9D1B9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mrpl28Q9D1B9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mrpl28Q9D1B9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mrpl28Q9D1B9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mrpl28Q9D1B9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Mrpl28Q9D1B9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mrpl28Q9D1B9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Mrpl28Q9D1B9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mrpl28Q9D1B9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mrpl28Q9D1B9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Mrpl28Q9D1B9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mrpl28Q9D1B9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Mrpl28Q9D1B9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mrpl28Q9D1B9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mrpl28Q9D1B9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mrpl28Q9D1B9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mrpl28Q9D1B9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mrpl28Q9D1B9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl28Q9D1B9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrpl28Q9D1B9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrpl28Q9D1B9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mrpl28Q9D1B9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mrpl28Q9D1B9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mrpl28Q9D1B9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mrpl28Q9D1B9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mrpl28Q9D1B9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Mrpl28Q9D1B9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mrpl28Q9D1B9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrpl28Q9D1B9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl28Q9D1B9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl28Q9D1B9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl28Q9D1B9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl28Q9D1B9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrpl28Q9D1B9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mrpl28Q9D1B9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mrpl28Q9D1B9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrpl28Q9D1B9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mrpl28Q9D1B9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mrpl28Q9D1B9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mrpl28Q9D1B9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mrpl28Q9D1B9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mrpl28Q9D1B9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl28Q9D1B9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mrpl28Q9D1B9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl28Q9D1B9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl28Q9D1B9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl28Q9D1B9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl28Q9D1B9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrpl28Q9D1B9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrpl28Q9D1B9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl28Q9D1B9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mrpl28Q9D1B9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl28Q9D1B9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mrpl28Q9D1B9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mrpl28Q9D1B9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl28Q9D1B9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl28Q9D1B9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl28Q9D1B9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl28Q9D1B9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrpl28Q9D1B9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mrpl28Q9D1B9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mrpl28Q9D1B9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mrpl28Q9D1B9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrpl28Q9D1B9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrpl28Q9D1B9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl28Q9D1B9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl28Q9D1B9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl28Q9D1B9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl28Q9D1B9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl28Q9D1B9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl28Q9D1B9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl28Q9D1B9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl28Q9D1B9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl28Q9D1B9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl28Q9D1B9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl28Q9D1B9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl28Q9D1B9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl28Q9D1B9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl28Q9D1B9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl28Q9D1B9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl28Q9D1B9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl28Q9D1B9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl28Q9D1B9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms