RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-DMb2Q31099 261 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RprmlQ3URD2 117 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5464Q3UY29 175 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usf2Q64705 346 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab3ipQ68EF0 428 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1126Q7TR49 314 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sult1c1Q80VR3 304 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mob3aQ8BSU7 217 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm9958Q8C9U4 106 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Exosc2Q8VBV3 293 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr720Q8VF37 316 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1457Q8VFK3 317 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D6Wsu163eQ91YN0 552 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tomm20lQ9D4V6 152 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snx5Q9D8U8 404 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfand6Q9DCH6 223 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bhlha15Q9QYC3 197 aa8.78□□□□□ -1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl23a-ps3A0A140T8M7 156 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp114B2RRA8 586 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnaset2aC0HKG5 259 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnaset2bC0HKG6 259 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ascl4M0QW46 144 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfsf12O54907 249 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NnmtO55239 264 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10226O88253 85 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klk1b4P00757 256 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B4galt1P15535 399 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm813Q3UWK9 176 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr222Q7TS30 318 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr70Q80ZX9 316 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nhlrc1Q8BR37 401 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smim4Q8C1Q6 80 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dhrs7cQ8CHS7 311 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Esco2Q8CIB9 592 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mnd1Q8K396 205 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nabp2Q8R2Y9 212 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr167Q8VGJ5 312 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B3gnt9Q8VI16 399 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dram2Q9CR48 267 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp23Q9CWQ3 201 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tlnrd1Q9ERE8 362 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nqo2Q9JI75 231 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sfrp4Q9Z1N6 351 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bcl3Q9Z2F6 448 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec4dQ9Z2H6 219 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm17087V9GXQ2 156 aa8.77□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-22A0A075B5U7 117 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr753-ps1A0A140LHN3 164 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankdd1aA0A1L1ST07 508 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 1700025C18RikA2A580 89 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FggyA2AJL3 552 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 S100zB9EJL3 99 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mmp27D3YV89 551 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CatsperdE9Q9F6 805 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20815J3KMI0 227 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20914J3QME2 227 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nipsnap1O55125 284 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbbp9O88851 186 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CyctP00015 105 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GrprP21729 384 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab22aP35285 194 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DckP43346 260 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21292Q78EE2 227 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Samd10Q7TST3 202 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fads6Q80UG1 342 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H1fxQ80ZM5 188 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psg22Q810J1 475 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxw26Q8BI58 466 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aadacl4Q8BM81 407 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Txnl4bQ8BUH1 149 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smco1Q8CEZ1 214 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dync2li1Q8K0T2 351 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8VC23 124 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1301Q8VGE7 312 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab3bQ9CZT8 219 aa8.76□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Csmd3Q80T79 3707 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-47A0A0A6YY41 117 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 1700031F05RikB1AX30 191 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r80E9Q1L0 863 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr557E9Q550 322 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6614M0QWR8 670 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GamtO35969 236 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdk1P11440 297 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psmd7P26516 321 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fgf9P54130 208 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ActbP60710 375 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl23aP62751 156 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 KncnQ307W7 124 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NotoQ5TIS6 240 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zdhhc23Q5Y5T3 425 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SrmQ64674 302 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Megf10Q6DIB5 1147 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tgm6Q8BM11 706 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm9961Q8BNV2 113 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem177Q8BPE4 311 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf146Q8BQN6 292 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930451G09RikQ8C5G4 195 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CmblQ8R1G2 245 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r222Q8R269 308 aa8.75□□□□□ -1.01
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1195Q8VG21 308 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.2 ms